[发明专利]诱变方法有效
申请号: | 201080058248.3 | 申请日: | 2010-12-21 |
公开(公告)号: | CN102695795A | 公开(公告)日: | 2012-09-26 |
发明(设计)人: | T.霍维南;U.拉明马基;E-C.布罗克曼;M.维尼艾南 | 申请(专利权)人: | 图尔库大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/68 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 李慧惠;郭文洁 |
地址: | 芬兰*** | 国省代码: | 芬兰;FI |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 诱变 方法 | ||
1. 一种诱变核酸分子的方法,所述方法包括下述步骤:
a)提供模板,所述模板包含在环状DNA载体中的靶核酸分子,
b)提供至少一种诱变引物,其含有要导入靶核酸分子中的突变,
c)使所述诱变引物与靶核酸分子退火,
d)进行引物延伸和连接反应,以形成双链的异源双链体,其中一条链是模板链,另一条链是新合成的突变链,
e)使模板链不适于滚环扩增(RCA),
f)通过多次引发的滚环扩增来扩增所述突变链,和
g)将扩增的DNA转化至合适的宿主中。
2. 根据权利要求1所述的方法,所述方法包括在步骤f)和g)之间的额外步骤,其中所述扩增的DNA通过下述方法转化成质粒大小的单位:(i)用限制性酶消化,(ii)用限制性酶消化和用DNA连接酶连接,或(iii)通过重组。
3. 根据权利要求1所述的方法,其中步骤a)的模板含有尿嘧啶,且在步骤e)中,通过尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)处理,使所述模板链不适于RCA。
4. 根据权利要求3所述的方法,其中所述模板是从ung-/dut- 大肠杆菌株得到。
5. 根据权利要求1所述的方法,其中步骤a)的模板是甲基化的且尿苷酸化的dsDNA,在步骤e)中通过UDG和DpnI限制性酶处理使模板dsDNA不适于RCA。
6. 根据权利要求5所述的方法,其中所述模板是从dam+/ung-/dut- 大肠杆菌株得到。
7. 根据权利要求1所述的方法,其中步骤a)的模板含有甲基,且在步骤e)中,通过限制性酶处理使所述模板链不适于RCA,所述限制性酶能够消化甲基化的DNA,但是不能消化未甲基化的DNA。
8. 根据权利要求7所述的方法,其中所述限制性酶是DpnI。
9. 根据权利要求7所述的方法,其中所述模板是从dam+ 大肠杆菌株得到。
10. 根据权利要求1所述的方法,其中在有甲基化剂存在下进行步骤d)的引物延伸反应,且在步骤e)中通过限制性酶处理使所述模板链不适于RCA,所述限制性酶能够使未甲基化的链产生切口,并使甲基化的链保持完整。
11. 根据权利要求10所述的方法,其中所述限制性酶选自MspI和HaeIII。
12. 根据权利要求10所述的方法,其中所述模板是从dam- 大肠杆菌株得到。
13. 根据权利要求10-12中任一项所述的方法,所述方法另外包括:在用限制性酶进行所述处理以后,用外切核酸酶处理。
14. 根据权利要求1所述的方法,其中在步骤e)中,通过用仅在模板链中具有识别位点的产生切口的内切核酸酶处理,使所述模板链不适于RCA。
15. 根据权利要求14所述的方法,所述方法另外包括:在产生切口的内切核酸酶处理以后,用外切核酸酶处理。
16. 根据前述任一项权利要求所述的方法,其中所述诱变引物含有至少一个定点突变。
17. 根据前述任一项权利要求所述的方法,其中所述诱变引物含有至少一个随机突变。
18. 根据前述任一项权利要求所述的方法,其中用phi29 DNA聚合酶进行所述滚环扩增。
19. 根据前述任一项权利要求所述的方法,其中在产生随机突变的条件下进行所述滚环扩增。
20. 根据权利要求19所述的方法,其中所述条件选自:减少模板量、给滚环扩增补充MnCl2和给滚环扩增补充三磷酸核苷酸类似物。
21. 根据前述任一项权利要求所述的方法,其中要诱变的核酸分子是双链DNA的形式,且所述方法包括:在步骤c)之前,打开所述双链结构。
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