[发明专利]用于心血管疾病的诊断和分类的生物标记物检验无效
申请号: | 201080063521.1 | 申请日: | 2010-12-09 |
公开(公告)号: | CN102762743A | 公开(公告)日: | 2012-10-31 |
发明(设计)人: | 道格·哈林顿;艾万格罗斯·海托普洛斯;布鲁斯·菲尔普斯 | 申请(专利权)人: | 阿维埃尔公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G06F19/18;G01N33/68 |
代理公司: | 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258 | 代理人: | 肖善强 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 心血管疾病 诊断 分类 生物 标记 检验 | ||
1.用于评价人的心血管健康的方法,其包括:
a)从人获得生物样品;
b)测定生物样品中的选自表20中列出的miRNA的至少2种miRNA标记物水平;
c)获得包括每种miRNA标记物水平的数据集;
d)将所述数据输进分析分类程序,所述程序使用所述数据对生物样品分类,其中分类选自由动脉粥样硬化心血管疾病分类、健康分类、药物暴露分类、非药物暴露分类组成的组;和
e)基于步骤(d)中的分类确定针对所述人的治疗方案;
其中所述人的心血管健康被评价。
2.根据权利要求1方法,其中所述至少2种miRNA标记物选自下述组:miR-378、miR-497、miR-21、miR-15b、miR-99a、miR-29a、miR-24、miR-30b、miR-29c、miR-331.3p、miR-19a、miR-22、miR-126、let-7b、miR-502.3和miR-652。
3.根据权利要求2的方法,其中所述至少2种miRNA标记物选自下述组:miR-378、miR-497、miR-21、miR-15b、miR-99a和miR-652。
4.根据权利要求1的方法,其中所述动脉粥样硬化心血管疾病分类选自下述组:冠状动脉疾病、心肌梗塞和不稳定型心绞痛。
5.根据权利要求1的方法,还包括使用所述分类用于测定动脉粥样硬化诊断、动脉粥样硬化分期、动脉粥样硬化预后、血管炎症水平、动脉粥样硬化发展程度、监测治疗响应、预测冠状动脉钙化评分、将动脉粥样硬化疾病的稳定与不稳定表现区分开、和它们的组合。
6.根据权利要求1的方法,其中所述数据集还包括一个或多个临床指标的数据。
7.根据权利要求6的方法,其中所述一个或多个临床指标选自下述组:年龄、性别、LDL浓度、HDL浓度、甘油三酯浓度、血压、体重指数、CRP浓度、冠状动脉钙化评分、腰围、吸烟状况、心血管疾病的过去病史、心血管疾病的家族史、心率、空腹胰岛素浓度、空腹葡萄糖浓度、糖尿病状况、使用的高血压药物及其组合。
8.根据权利要求7的方法,其中选择的所述临床指标是年龄、性别、糖尿病和MI家族史。
9.根据权利要求1的方法,其中所述生物样品包含血液、血清、血浆、唾液、尿、汗液、母乳及其组合。
10.根据权利要求1的方法,还包括测定所述生物样品中的至少一种蛋白生物标记物水平。
11.根据权利要求10的方法,其中所述至少一种蛋白生物标记物选自下述组:IL-16、sfas、Fas配体、MCP-3、HGF、CTACK、嗜酸性粒细胞活化趋化因子、脂联素、IL-18、TIMP.4、TIMP.1、CRP、VEGF和EGF。
12.根据权利要求11的方法,其中所述至少一种蛋白生物标记物选自下述组:IL-16、嗜酸性粒细胞活化趋化因子、Fas配体、CTACK、MCP-3、HGF和sFAS。
13.根据权利要求11的方法,其中测定了三种或更多种蛋白生物标记物水平。
14.根据权利要求1的方法,其中所述分析分类程序包括使用预测模型。
15.根据权利要求1的方法,其中所述分析分类程序包括将获得的数据集与参照数据集比较。
16.根据权利要求13的方法,其中所述预测模型包括用于分类的至少0.68的至少一个质量度量。
17.根据权利要求15的方法,其中所述质量度量是选自AUC和准确度。
18.根据权利要求1的方法,其中所述分析分类程序包括使用选自下述组的一种或多种:线性判别分析模型、支持向量机器分类算法、递归特征去除模型、微阵列模型的预测分析、逻辑回归模型、CART算法、flex tree算法、LART算法、随机森林算法、MART算法、机器学习算法、惩罚回归方法及其组合。
19.根据权利要求18的方法,其中所述分析分类程序包括选择的项目以提供至少0.68的质量度量。
20.根据权利要求18的方法,其中所述分析分类程序包括选择的项目以提供0.70的质量度量。
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