[发明专利]一种应用于建立虚拟计算机菌株的方法和系统无效
申请号: | 201110024307.1 | 申请日: | 2011-01-22 |
公开(公告)号: | CN102609632A | 公开(公告)日: | 2012-07-25 |
发明(设计)人: | 陈怡露;郑涛 | 申请(专利权)人: | 陈怡露;郑涛 |
主分类号: | G06F19/20 | 分类号: | G06F19/20 |
代理公司: | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人: | 卢亚丽 |
地址: | 210036 江苏省南京*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 应用于 建立 虚拟 计算机 菌株 方法 系统 | ||
1.一种应用于建立虚拟计算机菌株的方法和系统,包括以下步骤:
(1)用户指定需要合成的目的产物,
(2)在计算机上设计合适的最小基因组,即虚拟底盘微生物;
(3)通过对目的产物代谢途径、分子通路的分析建立针对目标产物的网络模型;
(4)根据步骤(3)建立的网络模型选择或者设计在工业条件下合成目的产物所需的DNA元件;
(5)将DNA元件和所需的启动子等调控元件设计出功能模块;
(6)将(5)中构建的功能模块插入最小基因组中,并通过优化的方法使其适配最小基因组,构建出面向目的产物的计算机菌株基因组;
(7)在计算机上设计计算机程序验证该虚拟基因组的稳定性和可控性;
(8)将最终稳定和可控的基因组设计模型交给用户。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于陈怡露;郑涛,未经陈怡露;郑涛许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
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G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用