[发明专利]一种应用于建立虚拟计算机菌株的方法和系统无效

专利信息
申请号: 201110024307.1 申请日: 2011-01-22
公开(公告)号: CN102609632A 公开(公告)日: 2012-07-25
发明(设计)人: 陈怡露;郑涛 申请(专利权)人: 陈怡露;郑涛
主分类号: G06F19/20 分类号: G06F19/20
代理公司: 南京知识律师事务所 32207 代理人: 卢亚丽
地址: 210036 江苏省南京*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 应用于 建立 虚拟 计算机 菌株 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种应用于建立虚拟计算机菌株的方法和系统,包括以下步骤:

(1)用户指定需要合成的目的产物,

(2)在计算机上设计合适的最小基因组,即虚拟底盘微生物;

(3)通过对目的产物代谢途径、分子通路的分析建立针对目标产物的网络模型;

(4)根据步骤(3)建立的网络模型选择或者设计在工业条件下合成目的产物所需的DNA元件;

(5)将DNA元件和所需的启动子等调控元件设计出功能模块;

(6)将(5)中构建的功能模块插入最小基因组中,并通过优化的方法使其适配最小基因组,构建出面向目的产物的计算机菌株基因组;

(7)在计算机上设计计算机程序验证该虚拟基因组的稳定性和可控性;

(8)将最终稳定和可控的基因组设计模型交给用户。

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