[发明专利]中国人群耳聋基因筛查用试剂盒及其使用方法有效
申请号: | 201110027435.1 | 申请日: | 2011-01-26 |
公开(公告)号: | CN102618624A | 公开(公告)日: | 2012-08-01 |
发明(设计)人: | 陈瑛 | 申请(专利权)人: | 苏州市立医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 苏州华博知识产权代理有限公司 32232 | 代理人: | 傅靖 |
地址: | 215000 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 中国 人群 耳聋 基因 筛查用 试剂盒 及其 使用方法 | ||
1.一种中国人群耳聋基因突变热点的筛查试剂盒,其特征在于,该试剂盒包括以下内容:
(1) PCR反应试剂,包括dNTP、5×和10×PCR缓冲液、Mg2+离子、FastTaq酶、SNaPshot Multiplex 混合液;
(2) 等比例混合的针对耳聋基因6个区段进行多重PCR扩增的正向引物和反向引物;
(3) 按一定比例混合的针对耳聋基因7个突变热点的PCR延伸引物;
(4) 纯化试剂,包括SAP酶、Exon I酶及其配套的缓冲液;
(5) 对照标本,包括单个位点纯合、杂合突变的阳性对照标本、阴性对照标本,
所述试剂盒以GJB2基因235位点的delC和299-300位点delAT,SLC26A4基因2168位点的A→G突变和IVS7-2位点的A→G突变,线粒体DNA基因1555位点的A→G突变、3243位点的A→G突变和7445位点A→G突变共7个突变热点为检测对象,针对每个位点的突变分别设计出扩增引物和延伸引物,针对各个目的位点同时进行多重PCR扩增和标记延伸,通过毛细管电泳分析,一次获得7个位点的基因型。
2.如权利要求1所述的用于筛查中国人群耳聋基因的试剂盒,其特征在于,所述GJB2基因235位点的扩增引物序列是ATGCTTGCTTACCCAGAC和GATCTCCTCGATGTCCTTA。
3.如权利要求1所述的用于筛查中国人群耳聋基因的试剂盒,其特征在于,所述GJB2基因299位点的扩增引物序列与所述235位点的扩增引物序列一致。
4.如权利要求1所述的用于筛查中国人群耳聋基因的试剂盒,其特征在于,所述SLC26A4基因2168位点的扩增引物序列是GCCTGGGCAATAGAATGAGACT和CCCTCTTGAGATTTCACTTGGT。
5.如权利要求1所述的用于筛查中国人群耳聋基因的试剂盒,其特征在于,所述SLC26A4基因IVS7-2位点的扩增引物序列是ACAAAATCCCAGTCCCTATTCCTA和TATGGTTGTTTCTTCCAGATCACA。
6.如权利要求1所述的用于筛查中国人群耳聋基因的试剂盒,其特征在于,所述线粒体DNA基因1555位点的扩增引物序列是AAAACTACGATAGCCCTTATGAAAC和AGTGTAAGTTGGGTGCTTTGTGTT。
7.如权利要求1所述的用于筛查中国人群耳聋基因的试剂盒,其特征在于,所述线粒体DNA基因3243位点的扩增引物序列是GGAGTAATCCAGGTCGGTTTCTATC和TGGCGTCAGCGAAGGGTTGT。
8.如权利要求1所述的用于筛查中国人群耳聋基因的试剂盒,其特征在于,所述线粒体DNA基因7445位点的扩增引物序列是ATCTAACTTTCTTCCCACAACACTT和AATGGTTTTTCTAATACCTTTTTGA。
9.如权利要求1所述的用于筛查中国人群耳聋基因的试剂盒,其特征在于,内装等比例混合的针对耳聋基因8个区段进行多重PCR扩增的正向引物和反向引物, 及按一定比例混合的针对耳聋基因14个突变热点的PCR延伸引物,
所述试剂盒以GJB2基因35位点delG、109位点G→A突变、176-191位点缺失16个碱基、235位点delC和299-300位点delAT,SLC26A4基因1174位点的A→T突变、1229位点的A→G突变、2027位点的T→A突变、2168位点的A→G突变和IVS7-2位点的A→G突变,线粒体DNA 1494位点的C→T突变、1555位点的A→G突变、3243位点的A→G突变和7445位点A→G突变共14个位点为检测对象,针对每个位点的突变类型分别设计出扩增引物和延伸引物,针对各个目的区段同时进行多重PCR扩增和标记延伸,通过毛细管电泳分析,一次获得14个位点的基因型。
10.如权利要求9所述的用于筛查中国人群耳聋基因的试剂盒,其特征在于,所述GJB2基因35位点的扩增引物序列与所述235位点的扩增引物序列一致。
11.如权利要求9所述的用于筛查中国人群耳聋基因的试剂盒,其特征在于,所述GJB2基因109位点的扩增引物序列与所述235位点的扩增引物序列一致。
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