[发明专利]DNA,RNA及蛋白胶电子化标准和分析应用软件无效
申请号: | 201110048102.7 | 申请日: | 2011-02-20 |
公开(公告)号: | CN102646170A | 公开(公告)日: | 2012-08-22 |
发明(设计)人: | 李卉 | 申请(专利权)人: | 李卉 |
主分类号: | G06F19/10 | 分类号: | G06F19/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 830000 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐*** | 国省代码: | 新疆;65 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | dna rna 蛋白 电子 标准 分析 应用软件 | ||
技术领域 本项发明属于分子生物技术应用领域,他可应用在对所有生物(包括动物,植物,微生物等)的DNA,RNA及蛋白质样品的检测过程,为这些样品检测提供DNA,RNA及蛋白质电子化标准及分析应用软件。
背景技术 在分子生物学实验中,研究人员在检测生物标本中DNA片段(限制性内切酶切片段;PCR扩増片段;分子克隆等DNA片段检测中);在检检测基因表达产物mRNA时;在检测蛋白质水平变化中,均要先进行琼脂糖胶的分离,染色及鉴定。其中,在进行每一块胶的实际生物样品分离过程中均要同时在第一泳道加上已知的DNA,RNA及蛋白质生物标准样品,用其在胶中已知的DNA,RNA片段大小,蛋白质分子量不同来作为标准参考提示要检测样品中的检测对象的片段及分子量大小。所以,DNA,RNA及蛋白质标准样品是在DNA,RNA及蛋白质生物标本分离鉴定中必不可少的生物制品。但因其制作复杂,成本高并可能在用后会对环境带来生物污染,故建立DNA,RNA及蛋白质电子标准图来取代传统的生物制品将是一场生物样品鉴定过程中的有意义的变革,它将产生巨大的经济和社会效益。
DNA,RNA及蛋白胶电泳上所用的生物标准物品系经过分子克隆,表达已知的基因的固定DNA片段及固定分子量的蛋白质后并加以纯化,组合而成的。其制作工艺复杂,周期长,成本高。且用后无法回收再利用,有潜在的生物污染危险。
本发明采用生物区带的数字化采集,建立资料库及计算机软件合成制图,可以完全取代DNA,RNA和蛋白传统的生物标准物产品,为节约生物资源,净化环境,提供准确实用的DNA,RNA,蛋白电子化标准奠定了基础。
传统的DNA,RNA及蛋白生物标准样品的制做方法:
1.传统的DNA生物标准样品是将选定长度的DNA片段克隆入质粒载体中,然后转染入细菌,大量复制后提取质粒DNA,用限制性内切酶切出DNA片段并进行大量纯化分离,最后与不同片段长度的DNA按比例混合,配制成DNA生物标准样品。
2.RNA生物标准样品是将固定长度表达的RNA分离纯化,然后与其他不同长度的RNA片段混合成RNA生物标准样品。
3.蛋白生物标准样品是将已知分子大小(分子量)表达的蛋白进行克隆,然后进行转染或体外表达,对表达的蛋白进行分离纯化,最后不同分子量的蛋白纯化物按比例混合后形成蛋白生物标准物。
发明内容 本发明的核心内容包括:首先,采用生物用品公司购入的DNA,RNA及蛋白生物标准样品,用其在制式电泳槽系统中,在固定的胶浓度,固定的时间,固定的电压,电 流下(例如:1%的胶,在80伏电压下,在1xTAE溶液中走胶30分钟)进行胶分离,然后用溴乙啶(寖染DNA,RNA胶)用氯化银(染蛋白胶)染色后进行各标准区带分离后与原点之间距离的测量,数据汇集并形成资料库,编制计算机胶成像分析软件(软件具备采图,建立数据库,拼建新图形成新的图示计算平台,设置分析,计算功能,储备功能,传送功能),在其应用软件内转化成电子标准区带图,此电子标准区带图可与软件获取的实际标本的DNA,RNA及蛋白胶分离图像(用尺子标定的图像)再拼接成新的图像(含电子标准区带和胶分离的实际样品区带),供后续分析,储存,使用。
电子化DNA,RNA,蛋白标准及应用软件的制作过程及要点:
1.采用生物用平公司购入的DNA,RNA及蛋白生物标准物,用其在制式电泳槽系统中,在固定的骄傲浓度,固定的时间,固定的电压,电流下进行胶分离,然后用溴乙啶(侵染DNA,RNA胶)用氯化银(染蛋白胶)染色后进行标准区带分离后进行其与上样原点之间距离的测量,数据汇集并形成资料库,编制计算机胶成像分析软件(软件具备采图,建立数据库,拼建新图形成新的图示计算平台,设置分析,计算功能,储备功能,传送功能),在其应用软件内将数据资料转化成电子标准区带图(见图1),每一电子标准区带图显示的是在固定胶浓度,电压,电流,固定胶分离时间条件下点样原点以及各标准区带(含标定的尺度:上样点为零,在胶上分离的标准区带与原点的距离被标定),每一电子标准区带图可用固定胶浓度,电压,电流,固定胶分离时间从软件资料图库中检索调取出来。
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