[发明专利]副猪嗜血杆菌实时荧光定量PCR检测方法无效
申请号: | 201110048711.2 | 申请日: | 2011-03-01 |
公开(公告)号: | CN102174653A | 公开(公告)日: | 2011-09-07 |
发明(设计)人: | 李军;陈泽祥;杨威;谢宇舟;彭昊;禤雄标;谢永平;许力干;胡帅;马春霞;潘艳 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12R1/21 |
代理公司: | 广西南宁公平专利事务所有限责任公司 45104 | 代理人: | 翁建华 |
地址: | 530001 广西*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 嗜血 杆菌 实时 荧光 定量 pcr 检测 方法 | ||
1.一种副猪嗜血杆菌实时荧光定量PCR检测方法,通过荧光染料嵌合PCR反应中所发出的荧光信号进行检测,其特征在于以登录号AB004028的副猪嗜血杆菌的16S rRNA基因序列为参考,其引物序列和扩增序列分别为:
引物序列1 5’-GAC GGG AAA CTG TCG CTA-3’
引物序列2 5’-CTA GAG ATC GTC GGC TTG-3’
扩增序列为序列表SEQ.ID.No.3的碱基序列。
2.根据权利要求1所述的副猪嗜血杆菌实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于所述方法包括如下步骤:
<1>制备DNA样本:取待检样本进行总DNA的提取纯化;
<2>实时荧光定量PCR反应:取步骤<1>所得DNA样本作为模板进行荧光PCR扩增,并同时分别以标准品DNA和去离子水为阳性对照样本和阴性对照样本进行荧光PCR扩增;
<3>建立标准曲线:取已知浓度的标准品DNA按10倍稀释法稀释成5×107~5×100拷贝/μL 8个浓度梯度,按步骤<2>的PCR反应体系和反应程序进行扩增,反应结束后,根据得到的各浓度梯度的循环阈值Ct绘制荧光定量PCR标准曲线;
将DNA样本的循环阈值Ct与标准曲线对照,得到待检DNA样本中的16S rRNA基因片段拷贝浓度,据此得到样本中的副猪嗜血杆菌的细菌数量。
3.根据权利要求2所述的副猪嗜血杆菌实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于所述荧光定量PCR反应的反应体系、扩增程序和测定扩增片段的熔解程序分别为:
反应体系:PCR混合液20μL,其中SYBR Green I Mix 9μL、5pmol/μL的上下游引物各0.3μL、DNA模板2.5μL以及去离子水7.9μL;
扩增程序:95℃5min,随后进行40个循环,每个循环包括95℃20s,62℃20s,68℃20s:
测定扩增片段的熔解程序:按每0.5℃/10s的升温速率从55℃升至95℃进行熔解曲线分析验证。
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