[发明专利]单标记寡聚核苷酸荧光探针及检测核酸酶的方法有效
申请号: | 201110049749.1 | 申请日: | 2011-03-01 |
公开(公告)号: | CN102154489A | 公开(公告)日: | 2011-08-17 |
发明(设计)人: | 赵美萍;宋晨;张晨;苏昕 | 申请(专利权)人: | 北京大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京君尚知识产权代理事务所(普通合伙) 11200 | 代理人: | 李稚婷 |
地址: | 100871*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 标记 核苷酸 荧光 探针 检测 核酸酶 方法 | ||
1.一种单标记寡聚核苷酸荧光探针,具有茎环结构,其环部为单链结构,茎部为双链结构,茎部末端是3个以上的连续C碱基和连续G碱基组成的G-C碱基对,C碱基端标记荧光基团,G碱基端具有荧光淬灭作用。
2.一种单标记寡聚核苷酸荧光探针,具有茎环结构,其环部为单链结构,茎部由6-10对互补碱基构成的双链和5’-(dC)4-8侧链组成,且5’-端标记荧光基团。
3.如权利要求1或2所述的单标记寡聚核苷酸荧光探针,其特征在于,所述环部由5-24个核苷酸残基组成。
4.如权利要求1或2所述的单标记寡聚核苷酸荧光探针,其特征在于,所述荧光基团是6-羧基荧光素、5-四氯荧光素、5-六氯荧光素、6-羧基罗丹明x或6-羧基四甲基罗丹明。
5.权利要求1所述的单标记寡聚核苷酸荧光探针在核酸酶检测中的应用。
6.如权利要求5所述的应用,其特征在于,所检测的核酸酶是下列所述酶i)或酶ii):
i)对双链DNA的3’或5’末端或者末端附近序列具有切割活性的核酸酶;
ii)以双链DNA的3’或5’末端为反应底物,且与i)所述的核酸酶联用能够切割双链DNA的3’或5’末端或者末端附近序列的核酸酶;
以所述单标记寡聚核苷酸荧光探针作为DNA底物与所述核酸酶反应,实时检测荧光信号的变化,从而分析核酸酶的活性以及酶与DNA反应的动力学过程。
7.如权利要求6所述的应用,其特征在于,所检测的核酸酶是下列酶中的一种:作用于双链DNA的核酸外切酶、限制性内切酶、作用于双链DNA的修饰酶、具有脱嘌呤/脱嘧啶裂解酶活性的修复酶和对损伤的鸟嘌呤位点具有N-糖基化酶活性的修复酶。
8.权利要求2所述的单标记寡聚核苷酸荧光探针在核酸酶检测中的应用。
9.如权利要求8所述的应用,其特征在于,所检测的核酸酶是下列所述酶1)或酶2):
1)具有聚合活性或者聚合和保真活性的DNA聚合酶;
2)与1)所述DNA聚合酶联用,使得DNA的聚合延伸反应得以实现的酶。
以所述单标记寡聚核苷酸荧光探针作为DNA底物与所述核酸酶反应,实时检测荧光信号的变化,从而分析核酸酶的活性以及酶与DNA反应的动力学过程。
10.如权利要求8所述的应用,其特征在于,所述酶2)是具有3’-端去磷酸化活性的激酶和磷酸酶。
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