[发明专利]芸薹属核心SSR引物组合

说明书

技术领域

本发明涉及分子遗传技术领域，特别是涉及一种芸薹属核心SSR引物组合。

背景技术

分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是DNA水平遗传多态性的直接反映。DNA由于信息含量大，在同种内具有高度的遗传稳定性，且不受外界环境因素和生物个体发育阶段及器官组织差异的影响。分子标记技术是继形态学标记、生化免疫遗传标记和细胞遗传学标记后的一种新的标记技术，实现了从表型选择到基因型选择的飞跃。随着分子生物学技术的发展，DNA分子标记技术已在玉米、大豆、鸡、猪等动植物育种和生产中有许多应用研究，广泛应用于遗传图谱构建、基因定位、物种亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆和分子标记辅助选择等方面。自20世纪80年代以来，出现了多种分子标记方法，如RAPD、RFLP、AFLP、简单序列重复（SSR）和SNP等。

目前由于RAPD重现性较差；AFLP操作较复杂、稳定性较差，除QTL初步定位后在目标区域加密标记有独特的优势外，其它方面的应用逐步淡化出各种研究；RFLP操作过程繁琐，效率低，成本高，除在鉴定转基因是否成功外，在其它方面的研究地位越来越低。然而SSR广泛分布在真核生物整个基因组上，具有多态性高、稳定性强、操作简便、DNA用量少、表现为共显性孟德尔遗传等优点，已经广泛用于各项标记技术中，并且已成为最有应用价值和应用最广泛的分子标记技术。

芸薹属(Brassica )属于十字花科，是一类具有极高经济价值的作物，其包含有许多重要的蔬菜、油料、饲料作物和调味品，如甘蓝类( B. oleracea) 的结球甘蓝、花椰菜、青花菜、芥蓝和苤蓝；白菜类( B. campestris) 的大白菜、白菜、乌塌菜、菜薹等，它们都在中国有广泛的栽培。自Song等人（1988）开辟了芸薹属植物分子标记研究的新领域以来，经过近20年多的研究，分子标记技术在芸薹属作物中得到了广泛的应用。尽管目前已经开发了数千多个芸薹属作物SSR引物, 然而不是所有的SSR引物都具有同等的应用价值，包括扩增效果、多态性信息含量、多态性水平高低、是否为共显性遗传、多位点拷贝数和是否被定位在遗传图谱上等。当我们利用SSR引物做标记时，通常做法是将目前所有已知的SSR进行筛选，然后从中选择自己所需要的引物，结果会对标记整体效果把握不准，造成较大的浪费，费时费力。

发明内容

本发明的目的在于提供一种芸薹属核心SSR引物组合，特别适合芸薹属作物种质资源鉴定、遗传多样性分析、品种纯度检测和缺体等异常染色体组成的鉴定等研究工作。

本发明的芸薹属19条染色体（A1-A10和C1-C9）核心SSR引物组合，包括以下引物：

A1  CB10369      ENA15  CB10097     NIAB096     Ra2E04      BRAS026  Na12C06      CNU397    Ol10D03       CB10597

A2  Ol10F04     Ol09A03     NIAB105SR6293     CB10416      Na12A07

CB10093    Ni2C12B  Na14H11C  BRAS083

A3  SR6688 BRMS071    NIAB120 CNU482   CNU409      BRMS176    Ol10B08

SN1919  Ol13D02A       Na12C07

A4  FITO066      SN13034      sNRD71       ENA3    Ol13D02A   CNU254

BRAS003    CB10196      CB10335       CB10493

A5 sNRD03      BRMS034   FITO130     BRAS063   NIAB082   SR9222ENA10

CB10080      SR9477       CB10487

A6 CB10330  CB10143   BRAS014  BRMS227    BRMS221    CB10065

BRMS226    BRMS261    CNU400 EJU5

A7 Ra2G08  SR0282R     FITO066      NIAB082     BRMS298    NIAB030