[发明专利]用于评定细胞中的基因转录水平的寡核苷酸探针

权利要求书

1.一组寡核苷酸探针，其中所述组包括至少10种选自如下的寡核苷酸：表1中描述的寡核苷酸或来源于表1描述的序列的寡核苷酸，或具有互补序列的寡核苷酸，或功能性等价的寡核苷酸。

2.权利要求1中要求保护的一组寡核苷酸探针，其中所述寡核苷酸探针选自：在表2中描述的寡核苷酸或来源于在表2描述的序列的寡核苷酸，或具有互补序列的寡核苷酸，或功能性等价的寡核苷酸。

3.权利要求1中要求保护的一组寡核苷酸探针，其中所述寡核苷酸探针选自：表4中描述的寡核苷酸或来源于在表4描述的序列的寡核苷酸，或具有互补序列的寡核苷酸，或功能性等价的寡核苷酸。

4.权利要求1-3的任何一项中要求保护的一组寡核苷酸探针，其中所述组中的各种探针结合到不同转录物上。

5.权利要求1-4的任何一项中要求保护的探针组，由10-500种寡核苷酸探针组成。

6.一种寡核苷酸探针，其中所述探针选自列举在表1中的寡核苷酸，或来源于在表1中描述的序列的寡核苷酸，或其互补序列。

7.权利要求1-5的任何一项中要求保护的一组寡核苷酸探针或权利要求6中要求保护的寡核苷酸探针，其中各种所述寡核苷酸探针长度为15-200个碱基。

8.权利要求1-5或7的任何一项中要求保护的一组寡核苷酸探针或权利要求6或7中要求保护的寡核苷酸探针，其中所述探针结合的转录物来源于被组成型地中度或高度表达的基因。

9.权利要求1-5、7或8的任何一项中要求保护的一组寡核苷酸探针或权利要求6-8中要求保护的寡核苷酸探针，其中所述探针被固定在一种或多种固体支持物上。

10.权利要求9要求保护的一组寡核苷酸探针或寡核苷酸探针，其中所述固体支持物是片、滤器、膜、平板或生物芯片。

11.由权利要求6中定义的寡核苷酸结合的mRNA序列编码的多肽。

12.权利要求11中定义的多肽的抗体。

13.包括固定在一种或多种在权利要求9或10中定义的固体支持物上的一组寡核苷酸探针的试剂盒。

14.权利要求13要求保护的试剂盒，其中所述探针被固定在单一的固体支持物上，各种独有的探针被附着到所述固体支持物的不同区域上。

15.如权利要求13或14要求保护的试剂盒，还包括进行标准化的物质。

16.权利要求1-5或7的任何一项所述的一组探针或者权利要求13-15中所述的试剂盒在确定细胞的基因表达模式中的用途，该模式反映所述寡核苷酸探针结合的基因的基因表达水平，其至少包括步骤：

a)从所述细胞中分离mRNA，可选择地将mRNA反转录为cDNA；

b)将步骤(a)的mRNA或cDNA杂交到权利要求1-5、7-10或13-15的任何一项定义的一组寡核苷酸或试剂盒上；和

c)评价杂交到所述探针上的mRNA或cDNA的含量，以生成所述模式。

17.一种制备标准基因转录模式的方法，该标准基因转录模式是生物体的疾病或病症或其阶段特征性的，该方法至少包括步骤：

a)从所述一种或多种患有疾病或病症或其阶段的生物体的样本的细胞中分离mRNA，可选择地将mRNA反转录为cDNA；

b)将步骤(a)的mRNA或cDNA杂交到特异于所述生物体及其样本的疾病或病症或其阶段的权利要求1-5、7-10或13-15的任何一项定义的一组寡核苷酸或试剂盒上，该生物体和样本对应于被研究的生物体及其样本；和

c)评价杂交到各种所述探针上的mRNA或cDNA的量，以生成特征性模式，该模式反映患有疾病、病症或其阶段的样本中，所述寡核苷酸结合的基因的基因表达水平。