[发明专利]鉴定水稻暗胚乳突变基因Wx-mq不同基因型的四引物标记方法有效
申请号: | 201110066393.2 | 申请日: | 2011-03-18 |
公开(公告)号: | CN102146472A | 公开(公告)日: | 2011-08-10 |
发明(设计)人: | 张亚东;赵庆勇;周丽慧;姚姝;陈涛;朱镇;赵凌;王才林 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 张素卿 |
地址: | 210014*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴定 水稻 胚乳 突变 基因 wx mq 不同 基因型 引物 标记 方法 | ||
1.一种鉴定水稻暗胚乳突变基因Wx-mq不同基因型的四引物PCR分子标记方法,其特征在于:
用Wx-mq基因特异性引物
正向外引物Wx-mq-O-F序列为 5'-ATGTTGTGTTCTTGTGTTCTTTGCAGGC-3'
反向外引物Wx-mq-O-R序列为 5'-GTAGATCTTCTCACCGGTCTTTCCCCAA-3'
正向内引物Wx-mq-I-F序列为 5'-GGGTGAGGTTTTTCCATTGCTACAATCG-3'
反向内引物Wx-mq-I-R序列为 5'-GTCGATGAACACACGGTCGACTCAAT-3'
扩增水稻品种的基因组DNA,如果同时有439 bp和292 bp两条特征条带,则为暗胚乳突变基因Wx-mq的纯合体;如果同时有439 bp和200 bp两条特征条带,则为不含暗胚乳突变基因Wx-mq的纯合体;如果同时存在439 bp、292 bp和200 bp的三条特征条带,则说明该植株是暗胚乳突变基因Wx-mq的杂合体。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:
(1)水稻植株基因组DNA的提取;
(2)将权利要求1所述的四条分子标记引物Wx-mq-O-F、Wx-mq-O-R、Wx-mq-I-F和Wx-mq-I-R加入同一PCR反应体系,并对水稻种质资源或育种群体植株的DNA进行扩增;20 μL PCR反应体系包括:10 ng/μL的 DNA 2.0 μL,4 pmol/ μL的引物2.0 μL ,其中引物Wx-mq-O-F、Wx-mq-O-R、Wx-mq-I-F和Wx-mq-I-R各0.5 μL,含25 mmol/L MgCl2的10×PCR Buffer 2.0 μL,2.5 mmol/L的dNTP 0.4 μL,5 U/μL 的Taq0.5 μL和ddH2O 13.1 μL;
PCR反应程序包括:95 ℃预变性5 min;然后95℃变性30s、65℃复性30s、72℃延伸1min,循环35次;然后72℃延伸7min,10℃冷却10min后,将扩增产物加上样缓冲液终止反应;
(3)反应产物在质量比浓度为1.5%的琼脂糖凝胶上电泳,经溴化乙锭染色并于凝胶成像系统下观察,记载。
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