[发明专利]一种染色体15q25区段SNP检测的特异性引物和液相芯片

说明书

技术领域

本发明属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种染色体15q25区段SNP检测的特异性引物和液相芯片。

背景技术

LOC123688是位于染色体15q25区段上的一个功能的基因，它主要负责编码尼古丁的细胞受体，目前研究表明，尼古丁通过这些受体，能促进肺癌的发展，促进癌细胞增殖、存活、迁移、入侵到邻近组织，甚至发展肿瘤的血液供应，因此该基因单核苷酸多态性(SNP)与肺癌的发生和发展相关。

此外，位于染色体15q25区段的编码尼古丁乙酰胆碱受体的候选基因CHRNA3亦与肺癌的发生风险相关，该基因上的基因突变是影响不可手术的IIIB期/IV期肺癌患者独立预后因素。

本发明目标检测的染色体15q25区段突变位点，如表所示：

  序号  位点突变的内容  简写  1  SEQ ID NO.41的第102位核苷酸，发生A→G突变  A102G  2  SEQ ID NO.42的第77位核苷酸，发生C→T突变  C77T  3  SEQ ID NO.43的第63位核苷酸，发生C→T突变  C63T  4  SEQ ID NO.44的第202位核苷酸，发生A→C突变  A202C  5  SEQ ID NO.45的第139位核苷酸，发生G→C突变  G139C

目前，对染色体15q25区段的LOC123688和CHRNA3基因多态性进行检测、分析的方法很多，如：传统固相芯片、PCR-RFLP法、TaqMan技术、直接测序等等，其中最常用的方法有荧光定量PCR和PCR-RFLP法。荧光定量PCR具有操作简便、结果快捷、量化等优点，但是，该技术存在样品易污染，易发生交叉反应，假阳性率高的缺点；而PCR-RFLP法是基于基因突变造成的限制性内切酶识别位点的改变，如位点丢失或产生新位点，通过PCR扩增某一特定片段，再用限制性内切酶酶切扩增产物，电泳观察片段的大小，这种方法用于检测酶切位点改变的基因突变，可直接判断基因型，但该法不能用于没有产生新酶切位点的基因突变检测。再次，除传统固相芯片以外的上述这些方法都存在着检测通量的局限性，每次只能检测一种突变类型，不能满足实际应用的需要。

发明内容

本发明的目的之一是提供染色体15q25区段SNP检测的液相芯片。该液相芯片可用于检测染色体15q25区段五种常见SNP位点A102G、C77T、C63T、A202C和G139C的野生型和突变型。

为实现上述目的，本发明采取了以下技术方案：

一种染色体15q25区段SNP检测的液相芯片，主要包括有：