[发明专利]含蛋白标签的SUMO融合蛋白及其应用无效
申请号: | 201110114671.7 | 申请日: | 2011-05-05 |
公开(公告)号: | CN102766214A | 公开(公告)日: | 2012-11-07 |
发明(设计)人: | 杨淑伟;焦少灼 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海生命科学研究院 |
主分类号: | C07K19/00 | 分类号: | C07K19/00;C12N15/62;C12N15/63;C12Q1/48;C12Q1/02;G01N33/68;C12Q1/68;A61K45/00;A61P25/00;A61P15/08 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 余颖 |
地址: | 200031 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 蛋白 标签 sumo 融合 及其 应用 | ||
1.一种如下所示的融合蛋白:
Tag-SUMO
其中,Tag表示蛋白标签,选自Avi标签、SNAP标签和Halo标签,
SUMO即类泛素化小蛋白;
所述融合蛋白具有SUMO化能力。
2.如权利要求1所述的融合蛋白,如下所示:
Tag-L-SUMO
其中,L表示柔性连接肽。
3.如权利要求2所述的融合蛋白,L是9个氨基酸的柔性连接肽,例如SSGLVPRGS所示的柔性连接肽。
4.如权利要求1所述的融合蛋白,所述SUMO是人类SUMO1的成熟形式。
5.一种核酸分子,选自编码权利要求1-4中任一项所述融合蛋白的核酸分子或其互补链。
6.一种载体,加载了权利要求5所述的核酸分子,优选表达载体,例如原核生物载体和哺乳动物表达载体。
7.一种在体外SUMO化修饰体系中检测SUMO化的方法,包括:
在体外SUMO化修饰体系中,将被检测蛋白与权利要求1-4中任一项所述的
融合蛋白接触,
检测被检测蛋白的SUMO化产物。
8.一种体外检测SUMO化的系统,包含权利要求1-4中任一项所述的融合蛋白,纯化的Ub1激活酶(E1),Ub1转移酶(E2)和Ubc9,以及SUMO化反应缓冲液,所述系统优选试剂盒形式。
9.一种细胞内检测SUMO化的方法,包括:
(1)用编码权利要求1-4中任一项所述融合蛋白的核酸分子转染宿主细胞;
(2)培养宿主细胞,获得蛋白表达;
(3)裂解细胞;
(4)检测被检测蛋白的SUMO化产物。
10.如权利要求9所述的方法,其中,步骤1)还包括用编码Ubc9的核酸分子转染宿主细胞。
11.如权利要求9所述的方法,其中,步骤1)还包括用编码待检测蛋白的核酸分子转染宿主细胞。
12.如权利要求9所述的方法,其中,还包括在步骤4)之前通过免疫沉淀或亲和层析步骤处理步骤3)所得细胞裂解物。
13.如权利要求9所述的方法,包括:
(1).将被检测蛋白的ORF装载到表达载体中,所述载体优选M11,
(2).将步骤(1)制备的载体、权利要求1-4中任一项所述融合蛋白的表达载体和Ubc9的表达载体一同转染到宿主细胞中,优选Hela细胞,所述融合蛋白优选SNAP-L-SUMO或Halo-L-SUMO融合蛋白,
(3).培养细胞,获得各蛋白的表达,
(4).收细胞后检测被检测蛋白的SUMO化产物,例如用WesternBlot法、电泳、免疫荧光或其组合来检测。
14.一种细胞内检测SUMO化的系统,包含:编码权利要求1-4中任一项所述融合蛋白的表达质粒,和转染试剂,,优选试剂盒形式。
15.如权利要求14所述细胞内检测SUMO化的系统,还包含编码Ubc9的表达质粒。
16.如权利要求14所述细胞内检测SUMO化的系统,所述融合蛋白是SNAP-L-SUMO或Halo-L-SUMO融合蛋白。
17.一种筛选SUMO化蛋白底物的方法,
提供作为SUMO化底物的候选蛋白,例如在高置信条件下用预测蛋白的被SUMO化能力的分析软件筛选作为SUMO化底物的候选蛋白,
检测候选蛋白的SUMO化,所述检测采用权利要求7所述体外SUMO化修饰体系中检测SUMO化的方法,或者采用权利要求9至13中任一项所述细胞内检测SUMO化的方法,或者两者的联用,
若检测到候选蛋白的SUMO化产物,表明候选蛋白是SUMO化蛋白底物。
18.一种检测细胞内SUMO修饰的靶蛋白的方法,包括:
(1)在细胞内重组表达权利要求1-4中任一项所述的融合蛋白;
(2)将细胞裂解液与结合、优选共价结合所述融合蛋白中标签的载体接触,所述载体例如微载体,例如珠粒;
(3)分析与载体接触的靶蛋白信息,例如WesternBlot或者MS分析。
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