[发明专利]一种检测RNA病毒hMPV的方法、试剂盒及应用无效
申请号: | 201110115340.5 | 申请日: | 2011-06-16 |
公开(公告)号: | CN102827946A | 公开(公告)日: | 2012-12-19 |
发明(设计)人: | 郑丽舒;王翔;侯云德 | 申请(专利权)人: | 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所;北京金迪克生物技术研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京元中知识产权代理有限责任公司 11223 | 代理人: | 王明霞 |
地址: | 100052 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 rna 病毒 hmpv 方法 试剂盒 应用 | ||
1.一种利用逆转录等温扩增技术检测RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,所述的检测方法包括以下步骤:根据人偏肺病毒的N基因的相对保守区,分别设计了六条引物,包括两条外引物F3、B3和两条内引物FIP、BIP,两条环结合引物LF、LB;处理待测标本,提取样本的RNA后,进行RT-LAMP反应;然后通过电泳检测或肉眼观察,最终得到检测结果;
其中,所述的引物的核苷酸序列为:
外引物F3的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,或由SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列;,
外引物B3的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示,或由SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列:
内引物FIP(F1c+F2)的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,或由SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列:
内引物BIP(B1c+B2)的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示,或由SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列:
环引物LF的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示,或由SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列:
环引物LB的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示,或由SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的利用逆转录等温扩增技术检测RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,所述RT-LAMP的反应体系为:
Bst DNA聚合酶缓冲液(10×),2.5μl;
BstDNA聚合酶(8u/μl),1μl;
AMV反转录酶(10u/μl),1μl;
dNTP(10mM),2.5μl;
Betaine(25mM),1μl;
MgCl2(150mM),1μl;
外引物F3、B3(5μM),各1μl;
内引物FIP、BIP(10μM),各1μl;
环引物LF、LB(20μM),各1μl;
DNA,1μl;
ddH2O,9μl;
总体积25μl。
3.根据权利要求1所述的利用逆转录等温扩增技术检测RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,所述RT-LAMP的反应条件为60~68℃恒温反应1~2h,优选65℃恒温1.5h;然后75~85℃灭活3~10min,优选80℃灭活5min。
4.根据权利要求1所述的利用逆转录等温扩增技术检测RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,所述提取样本RNA的方法为:以hMPV阳性RNA核酸为模板,使用两步法反转录试剂盒先进行第一步反转录以获取cDNA;以cDNA为模板并RT-PCR引物进行PCR反应,扩增条件为:95℃预变性5min,95℃变性30s,52℃退火30s,72℃延伸35s,35个循环,72℃延伸10min,4℃保存;
其中,RT-PCR引物F的核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示,或由SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列;
RT-PCR引物R的核苷酸序列如SEQ ID NO:8所示,或由SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列。
5.根据权利要求1所述的利用逆转录等温扩增技术检测RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,所述的电泳采用1%琼脂糖凝胶电泳,阳性结果在416bp处产生条带。
6.根据权利要求1所述的利用逆转录等温扩增技术检测RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,采用肉眼检测,浑浊有白色沉淀的为阳性,清亮透明的为阴性。
7.根据权利要求1所述的利用逆转录等温扩增技术检测RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,采用肉眼检测,在RT-LAMP的反应体系加入羟基萘酚兰,阳性反应呈蓝色,阴性反应呈紫色。
8.一种检测检测RNA病毒hMPV的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒中包括病毒RNA提取试剂盒、RT-LAMP的反应体系、定量参考品、阴性质控品、阳性质控品。
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