[发明专利]基于数字图像处理的DNA序列的二维图像表示方法有效

专利信息
申请号: 201110148917.2 申请日: 2011-06-03
公开(公告)号: CN102324002A 公开(公告)日: 2012-01-18
发明(设计)人: 刘咏梅 申请(专利权)人: 哈尔滨工程大学
主分类号: G06F19/20 分类号: G06F19/20
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 150001 黑龙江省哈尔滨市南岗区*** 国省代码: 黑龙江;23
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摘要:
搜索关键词: 基于 数字图像 处理 dna 序列 二维 图像 表示 方法
【权利要求书】:

1.基于数字图像处理的DNA序列的二维图像表示方法,其特征是:

步骤1,一维的DNA序列的二维图像矩阵排列;

步骤2,构造图像的像素灰度;

步骤3,计算DNA序列的转录模式在二维图像表示中的特征;将转录模式定义为图像中的目标物体部分,借助于图像中的物体识别方法,对定义的目标进行图像分割,对待识图像区域进行特征提取。

2.根据权利要求1所述的基于数字图像处理的DNA序列的二维图像表示方法,其特征是所述的一维的DNA序列的二维图像矩阵排列是按下列方式之一进行排列:①Line-by-line方式,将序列按顺序一行接着一行排列,确定矩阵列数后,到每行的最后一列时就开始新的一行的排列,去掉剩余的不完整的行或用某种碱基补齐;②S形方式,将序列按S形排列,确定矩阵列数后,从左到右排列到最后一列时,新的一行由右向左排列;从右到左排列到第一列时,新的一行由左向右排列,去掉剩余的不完整的行或用某种碱基补齐;③漩涡方式,确定矩阵列数后,将序列按漩涡形状由里向外或者由外向里排列,去掉剩余的不完整的行或者列或用某种碱基补齐;由外向里排列时,相当于从序列的末端开始由里向外排列。

3.根据权利要求1或2所述的基于数字图像处理的DNA序列的二维图像表示方法,其特征是所述构造图像的像素灰度是直接赋予四种碱基四个灰度,T为0、A为1、C为3、G为2。

4.根据权利要求1或2所述的基于数字图像处理的DNA序列的二维图像表示方法,其特征是所述构造图像的像素灰度是用16个、64个灰度级来赋予图像的灰度级。

5.根据权利要求4所述的基于数字图像处理的DNA序列的二维图像表示方法,其特征是按不同的灰度级构造的多幅图像进行叠加。

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