[发明专利]一种甘蔗宿根矮化病菌巢式PCR快速检测方法无效
申请号: | 201110172722.1 | 申请日: | 2011-06-24 |
公开(公告)号: | CN102230018A | 公开(公告)日: | 2011-11-02 |
发明(设计)人: | 沈万宽;刘睿;杨湛端;邓海华;陈健文;陈仲华 | 申请(专利权)人: | 广州甘蔗糖业研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 谭英强 |
地址: | 510316 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 甘蔗 宿根 矮化 病菌 pcr 快速 检测 方法 | ||
1.一种甘蔗宿根矮化病菌巢式PCR快速检测方法,包括如下步骤:
1) 提取待检样品的全DNA;
2) 以得到的全DNA为模板,以ITS1:5’– AGTCGTAACAAGGTAGCCGT -3’ (SEQ ID NO.1)和ITS2:5’– GTGCCAAGGCATCCACC -3’ (SEQ ID NO.2)为引物,进行首轮PCR,得到首轮PCR产物;
3) 以上述PCR产物为模板,以RL2:5’ –GAGACAGTACTTATCACTTCGG-3’ (SEQ ID NO.3)和RR2:5’– CGACGCAGATTGACCAATGATC -3’ (SEQ ID NO.4)为引物,进行二轮PCR;
4) 对二轮PCR产物进行电泳,根据371 bp目的片断的有无,判断样品为阳性或者阴性。
2.根据权利要求1所述的一种甘蔗宿根矮化病菌巢式PCR快速检测方法,其特征在于:首轮PCR的反应体系为:全DNA 1μl(含DNA 10-100 ng),5U/μL的 Taq酶0.2μl,10×含Mg2+ PCR反应缓冲液2.5μl,各dNTPs均为2.5 mmol/L的混合液2μl,5μmol/L的ITS1/ITS2引物各1μl,灭菌超纯水补足至25μl。
3.根据权利要求1所述的一种甘蔗宿根矮化病菌巢式PCR快速检测方法,其特征在于:首轮PCR的反应程序为:94℃ 5min;94℃ 30s,56℃ 40s,72℃ 1min;循环30次;72℃ 10min,4℃ 保存。
4.根据权利要求1所述的一种甘蔗宿根矮化病菌巢式PCR快速检测方法,其特征在于:二轮PCR的反应体系为:1μl首轮PCR扩增产物或其10倍稀释液,5μmol/L的引物RL2/RR2各1μl,10×含Mg2+ PCR反应缓冲液2.0 μl,各dNTPs均为2.5 mmol/L的混合液1.6μl,5U/μl的 Taq酶0.2μl,灭菌超纯水补足至20μl。
5.根据权利要求1所述的一种甘蔗宿根矮化病菌巢式PCR快速检测方法,其特征在于:二轮PCR的反应程序为:94℃预变性2min,1个循环;94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸60s,35-40个循环;72℃扩增5min,4℃ 保存。
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