[发明专利]具有潜在抗猪瘟病毒作用的IRG6基因克隆及其稳定表达细胞系的构建有效
申请号: | 201110180019.5 | 申请日: | 2011-06-30 |
公开(公告)号: | CN102899338A | 公开(公告)日: | 2013-01-30 |
发明(设计)人: | 罗廷荣;孙石开;蔡新斌;李晓宁;苏丽娟;尹珊;李晓泉;李延生 | 申请(专利权)人: | 广西大学 |
主分类号: | C12N15/54 | 分类号: | C12N15/54;C12N15/10;C12N15/85;C12N9/10;C12R1/91;C12R1/93 |
代理公司: | 广西南宁汇博专利代理有限公司 45114 | 代理人: | 邓晓安 |
地址: | 530004 广西*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 具有 潜在 猪瘟 病毒 作用 irg6 基因 克隆 及其 稳定 表达 细胞系 构建 | ||
1.一种抗猪瘟病毒的IRG6基因克隆及其稳定表达细胞系的构建,其特征在于:包括以下的步骤:
(1)基因片段的获得;(2)载体的构建;(3)稳定表达IRG6蛋白细胞系的筛选;(4)检测报告基因的表达;
所述的基因片段的获得,首先是采集猪瘟病毒感染猪的静脉血,用淋巴细胞分离液分离血液中的淋巴细胞,抽提细胞总RNA并反转录,然后根据NCBI数据库中公布的IRG6序列为模板,扩增出包含IRG6开放阅读框ORF的IRG6-KZ大片段;
所述的载体构建是以IRG6-KZ和PCDNA-GFP质粒为模板分别设计两对含有酶切位点的引物,扩增出IRG6-E和GFP-E,并运用双酶切、T4连接酶将GFP和IRG6分别亚克隆到PCDNA3.1载体上;所述的双酶分别为核酸内切酶Hind Ⅲ和Xho Ⅰ;
所述的IRG6稳定表达细胞系的筛选是将构建好的真核表达质粒转染PK-15细胞,继续培养转染质粒的细胞24小时后进行细胞传代,并使用终浓度为1000-1600μg/ml的G418筛选,以终浓度为400-800μg/ml G418为维持筛选浓度,连续筛选约14天后,挑单个克隆细胞株进行扩大培养,获得IRG6蛋白与GFP稳定表达的细胞系,通过RT-PCR检测到IRG6-GFP嵌合基因。
2.根据权利要求1所述的抗猪瘟病毒的IRG6基因克隆及其稳定表达细胞系的构建,其特征在于:淋巴细胞分离是静脉采集感染了猪瘟病毒的广西巴马香猪外周血10ml,用等量的PBS稀释。取4个离心管,分别加入5ml的淋巴细胞分离液,将20ml稀释的血液平均分成四份,分别沿管壁小心地注入已经加有淋巴细胞分离液的离心管中,使其分层,2000rpm,20min,小心吸取离心管中分离层的第二层白色的淋巴细胞,用等体积的PBS稀释,2000rpm离心5min,弃上清,加入5ml的红细胞裂解液,充分混匀,室温作用5-10min后,2000rpm,5min,弃上清,加入5ml PBS,吹散细胞,2000rpm,离心5min,弃上清,加入适量的PBS或者细胞培养液,吹散分装到小EP管中,得细胞悬液;然后取300μl的细胞悬液,加入600μl的Trizol,冰浴作用10min,放入-80℃保存,或者直接用于RNA的抽提。
3.根据权利要求1所述的抗猪瘟病毒的IRG6基因克隆及其稳定表达细胞系的构建,其特征在于:
所述的编码IRG6的基因,其功能与突变的核苷酸序列相同,突变形式包括缺失、无义、插入、错义。
4.如权利要求1所述的抗猪瘟病毒的IRG6基因克隆及其稳定表达细胞系的构建,其特征在于:猪的抗猪瘟病毒基因猪炎症反应基因6蛋白(Inflammatory response gene 6 protein,IRG6)基因,其核苷酸和蛋白质序列如下:
(1)核苷酸序列为:
ATGTGGACACTGGTACCTGTCACCTTTGCCCTCAGGCTGCTGAGCACCTTCGTGC
AGCCCCTGGGCTCGCTGGGCAGCAGCCTGGGACCCCTGTTCCTCTGGCTCTGGGC
AGCTTTCTGGCGGGCAGGGGGTGATAGGAGCCGGCAGCAGCTGCAGGGTAAAA
CAGAAGCTGGGGAACCCCCGAGGGCACAGGAGGACAGCCATCTGCCCACCACC
CCCACTAGCGTCAATTACCACTTCACCCGCCAGTGCAACTACAAGTGTGGCTTCT
GCTTCCACACGGCCAAGACATCCTTCGTGCTGCCCCTGGAGGAAGCCAAGAGAG
GCTTGTGGCTGCTGAAGGAAGCGGGTATGGAGAAGATCAACTTTTCAGGCGGAG
AGCCGTTTATCCACGACCGGGGCGAGTACCTGGGCAAGCTGGTCAGGTTCTGCA
AGGAGGAGCTACAGCTGCCCAGTGTCAGCATCGTGAGCAACGGGAGCCTGATCT
GGGAGAGGTGGTTCAAGAGCTATGGTGAATATCTGGACATTCTTGCCATCTCCTG
TGACAGCTTTGATGAGCAGGTCAATGTCCTTATTGGCCGTGGTCAGGGAAAGAA
GAACCATGTGGAAAATCTCCAAAAACTGAGGACGTGGTGCAGGGATTATAAAGT
GGCCTTCAAGATAAATTCAGTCATCAATCGCTTCAATGTGGAAGAAGATATGAC
AGAACACATCAAAGCTCTGAACCCTGTCCGCTGGAAGGTCTTCCAATGCCTCTTA
ATTGAGGGTGAGAATGTTGGAGAAGATGCTCTGAGAGAAGCAGAGCAGTTTGTT
ATCAGCGACGAAGAGTTTGAGGAATTCTTAGACCGCCACAAAGACGTGTCCTGC
TTGGTGCCCGAGTCTAACCGGCAGATGAGAGATTCCTACCTTATTCTGGATGAAT
ATATGCGCTTCCTGAACTGTAGAAACGGGCGGAAGGATCCATCCAAGTCCATCC
TGGATGTCGGGGTAGAAAAAGCCATAAAATTCAGTGGCTTTGATGAAAAGATGT
TTCTAAAGCGAGGAGGAAAATATGTATGGAGCAAGGCGGACCTGAAGCTGGACT
GGTGA;
(2)蛋白质序列:
MWTLVPVTFALRLLSTFVQPLGSLGSSLGPLFLWLWAAFWRAGGDRSRQQLQGKT
EAGEPPRAQEDSHLPTTPTSVNYHFTRQCNYKCGFCFHTAKTSFVLPLEEAKRGLWL
LKEAGMEKINFSGGEPFIHDRGEYLGKLVRFCKEELQLPSVSIVSNGSLIWERWFKSY
GEYLDILAISCDSFDEQVNVLIGRGQGKKNHVENLQKLRTWCRDYKVAFKINSVINR
FNVEEDMTEHIKALNPVRWKVFQCLLIEGENVGEDALREAEQFVISDEEFEEFLDRH
KDVSCLVPESNRQMRDSYLILDEYMRFLNCRNGRKDPSKSILDVGVEKAIKFSGFDE
KMFLKRGGKYVWSKADLKLDW。
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