[发明专利]乙型肝炎病毒阿德福韦酯耐药核酸定量检测试剂盒、检测方法、引物及其探针有效
申请号: | 201110194273.0 | 申请日: | 2011-07-12 |
公开(公告)号: | CN102304589A | 公开(公告)日: | 2012-01-04 |
发明(设计)人: | 唐景峰;王业富;刘绪 | 申请(专利权)人: | 武汉百泰基因工程有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64 |
代理公司: | 北京三高永信知识产权代理有限责任公司 11138 | 代理人: | 孟阿妮 |
地址: | 430223 湖北省武汉市东*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乙型肝炎 病毒 阿德福韦酯 耐药 核酸 定量 检测 试剂盒 方法 引物 及其 探针 | ||
1.一种乙型肝炎病毒阿德福韦酯耐药核酸定量检测试剂盒,其特征在于,该试剂盒含有:
(1)荧光定量PCR反应液:
其中包括DEPC处理水、具有5’→3’外切活性的DNA聚合酶、dNTPs、10×荧光定量PCRBuffer、含有Mg2+离子的溶液、rt181位点正向引物、rt181位点反向引物、rt181A位点探针、rt181V位点探针、rt181T位点探针、rtN236T检测试剂盒特有的rt236位点正向引物、rt236位点反向引物、rt236N位点探针和rt236T位点探针;
①181位点引物和探针
rt181位点正向引物:5′TACAAAACCTTCGGACGGAAA 3′
rt181位点反向引物:5′AAAGCCCTRCGAACCACTGA3′
rt181A探针序列:5′TTCTCHTGGCTCAGTTT 3′
rt181V探针序列:5′TTCTCHTGGTTCAGTTTA 3′
rt181T探针序列:5′TTCTCHTGACTCAGTTTA 3′
②236位点引物和探针
rt236位点正向引物:5′TCTGTACAACATCTTGAGTCCCTTT 3′
rt236位点反向引物:5′CCAACTYCCAATTACATATCCCAT 3′
rt236N探针序列:5′ATACATTTRAACCC 3′
rt236T探针序列:5′ATACATTTRACCCC 3′;
其中,上述探针的5’端和3’端分别用荧光基团修饰;所述引物序列中,Y=(C/T),R=(A/G),H=A/T/C:
(2)DNA提取液:
①溶液A,为聚乙二醇6000;
②溶液B,其中包括乙二胺四乙酸、十二烷基硫酸钠、Tris-HCl、乙基苯基聚乙二醇。
(3)质控品
①阴性质控品,为不含外源片段的PSG-TS载体质粒DNA;
②阳性质控品,检测rt181时,为1.0×106copy/mL的含有rt181A/rt181V/rt181T相应基因组的DNA片段,检测rt236时,为1.0×106copy/mL的含有rt236N/rt236T相应基因组的DNA片段;
③临界阳性质控品,检测rt181时,为1.0×104copy/mL的含有rt181A/rt181V/rt181T相应基因组的DNA片段,检测rt236时,为1.0×104copy/mL的含有rt236N/rt236T相应基因组的DNA片段;
(4)工作标准品:
检测rt181时,为PSG-TS rt181的质粒DNA,该质粒是在PSG-TS载体中插入了乙型肝炎病毒基因组中含有rt181A/rt181V/rt181T区间的162个碱基对的核苷酸片段所得的重组质粒;检测rt236时,为PSG-TS rt236的质粒DNA,该质粒是在PSG-TS载体中插入了乙型肝炎病毒基因组中含有rt236N/rt236T区间的153个碱基对的核苷酸片段所得的重组质粒;该2个重组质粒都在大肠杆菌DH5α中增殖。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,其中荧光探针的5’端修饰的荧光染料选自:FAM、HEX、TET、JOE、VIC、ROX、Cy3、Cy5、MAR、JUP、SAT、PLU或NEP;3’端修饰的荧光染料选自:TAMRA、Eclipse、BHQ1、BHQ2、BHQ3或DABCYL。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述DNA提取液由溶液A和溶液B组成;
所述溶液A,为聚乙二醇6000;
所述溶液B,其中包括乙二胺四乙酸、十二烷基硫酸钠、Tris-HCl和乙基苯基聚乙二醇。
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