[发明专利]一种制备DL2000 DNA分子量标准的方法及其产品和应用有效

专利信息
申请号: 201110216792.2 申请日: 2011-07-29
公开(公告)号: CN102304508A 公开(公告)日: 2012-01-04
发明(设计)人: 赫英俊;孙兰菊;严引娣 申请(专利权)人: 上海捷瑞生物工程有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12N15/11;C12Q1/68;C12N15/70;C12R1/19
代理公司: 上海智信专利代理有限公司 31002 代理人: 胡美强;沈利
地址: 200233 上海*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 制备 dl2000 dna 分子量 标准 方法 及其 产品 应用
【说明书】:

技术领域

发明属于生物工程领域,特别涉及一种制备DL2000DNA分子量标准的方法及其产品和应用。 

背景技术

DNA分子量标准俗称DNA Marker,是由一系列已知长度的DNA片段混合而成,是分子生物学实验中最常用的一种试剂。通过将实验中所得的DNA片段与DNA Marker在同一块琼脂糖凝胶中进行电泳,通过将样品片段与DNA Marker比较,就可以大致估计出实验所得的DNA片段的大小。 

DNA Marker的各条带通常有两种制备方案:PCR扩增和酶切质粒。 

PCR扩增的方案就是设计多套PCR引物进行扩增,得到相应大小的DNA片段。然后再对各片段进行纯化,定量。最后按比例将各片段混合,就得到了所需的产品。PCR扩增法制备DNA Marker存在着较大的缺陷,一是扩增的体积会有一定的限制。现在的PCR仪每个孔最多扩增体积不会超过70微升,以一台PCR仪96孔为例,最多一次可以扩增7毫升。更大的量就需要增加PCR仪及进行多次扩增。二是PCR扩增受多种条件影响较大,如仪器,模板,扩增用酶,不同批次的引物,及其他试剂,因此不同扩增批次之间差异会较大。三是PCR扩增的成功率相对较低,有较多的时间所扩增的条带可能有杂带,或目标条带专一性不太强,所扩增的条带较宽,或扩增产率较低,以及其他的不成功情况。 

常规质粒酶切的方法,由于DNA的条带亮度与其大小有正比例关系,在一个质粒中各片段酶切后其亮度可能会有较大差异,大片段比小片段亮。因此会导致所制备的终产品各条带之间亮度不均匀。 

DNA分子量标准是分子生物学实验室中最常用的一种试剂,而且属于消耗型的产品,市场用量很大。而DL2000类型的DNA分子量标准,由100bp,250bp,500bp,750bp(加亮作为指示带),1kb,2kb共6条DNA片段组成。它是实验室中用得最方便,也是使用最多的一种产品,消耗量很大。许多公司都有类似的产品出售。由于该DNA分子量标准中包含了小片段DNA,许多公司均采用PCR的方案进行产品制备。由于PCR生产中需要消耗大量人力资源及PCR仪,而且像100bp这种很小的DNA片段采用PCR扩增的方案效率特别低,扩增后的每个条带均需要进行纯化,并定量。然后再逐条带进行配制调整,得到最终产物。因而PCR扩增中不同批次之间会存在较大差别,并且很耗费人力及试剂,生产流程难于标准化。 

发明内容

本发明针对现有的DL2000DNA分子量标准的制备方法过程烦琐,批次之间质量不稳定,难以大规模生产的不足,提供一种新的制备DL2000类型的DNA分子量标准的方法及其产品和应用,其生产方便,可大规模生产,各批次之间质量稳定,DL2000 DNA分子量标准的各条件亮度均一。 

本发明通过下述技术方案解决了上述问题: 

本发明的第一技术方案是:一种制备DL2000 DNA分子量标准的方法,采用质粒酶切法,包括以下步骤:(1)DL2000 DNA分子量标准包括6个DNA片段:100bp,250bp,500bp,750bp,1kb,2kb,将该6个片段分配到两个载体中进行扩增,并且使它们在载体中具有特定的拷贝数,其中该6个片段的分配和拷贝数具体如下:载体1中包含片段100bp,拷贝数10;片段250bp,拷贝数4;片段500bp,拷贝数2;片段750bp,拷贝数1;和片段1kb,拷贝数1;载体2中包含2kb,拷贝数1;和片段750bp,拷贝数4;(2)将载体1和载体2用限制性内切酶进行酶切,然后混合,即得。 

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