[发明专利]油菜茎基溃疡病菌分子标准样品及其制备方法无效

专利信息
申请号: 201110219707.8 申请日: 2011-08-02
公开(公告)号: CN102277430A 公开(公告)日: 2011-12-14
发明(设计)人: 李鑫;刘冉;曹际娟;王有福 申请(专利权)人: 李鑫;刘冉;曹际娟;王有福
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/10;C12R1/645
代理公司: 大连星海专利事务所 21208 代理人: 于忠晶
地址: 116001 辽*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 油菜 溃疡 病菌 分子 标准 样品 及其 制备 方法
【权利要求书】:

1.油菜茎基溃疡病菌分子标准样品,其特征在于:以油菜茎基溃疡病菌菌株提取高纯度DNA为原料制得,标准样品具有下述的理化性质:(1)形状:纯白色粉末状;(2)每管的含量5μg ±0.5μg;(3)DNA纯度:OD260/280=1.8~2;(4)易溶于水,或TE(Tris-EDTA)缓冲液中。

2.根据权利要求1所述的油菜茎基溃疡病菌分子标准样品,其特征在于:DNA纯度:OD260/280=1.85。

3.油菜茎基溃疡病菌分子标准样品的制备方法,其特征是:包括如下步骤:

(1)油菜茎基溃疡病菌菌株采用马铃薯蔗糖(PD)液体培养基,置于20~22℃条件下培养5~7天;

(2)提取油菜茎基溃疡病菌DNA,采用CTAB方法提取DNA;

(3)核酸标准样品的制备:将测定浓度后的DNA按5μg±0.5μg /管进行分装,每种核酸分子标样分装100-400管,然后冻干,即为目的标准品。

4.根据权利要求1所述的油菜茎基溃疡病菌分子标准样品的制备方法,其特征是:所述提取油菜茎基溃疡病菌DNA,包括如下步骤:

①取0.1 g干菌丝置于预冷的研钵中,在液氮中迅速研磨成粉末状,把粉末迅速转入1.5 ml 的离心管中;

②向①中装有干菌丝粉末的离心管中加入800 μl 65℃预热的CTAB提取缓冲液,涡旋振荡充分混匀,65℃水浴50 min,每隔 10 min轻轻颠倒混匀一次;

③冷却至室温,再向②中离心管加入800μl的氯仿:异戊醇混合液,轻轻颠倒混匀,静置10 min,4℃10000 rpm离心10 min,取上清;

④向③中所得上清液中加入与该上清液等体积的氯仿:异戊醇混合液,轻轻颠倒混匀,静置10 min,4℃10000 rpm离心10 min,取上清;

⑤向④中所得上清液中加入与该上清液等体积的异丙醇或2倍体积冰无水乙醇,轻轻颠倒混匀,出现DNA絮状沉淀,放在冰上放置30 min沉淀DNA,4℃12000 rpm离心10 min,弃上清,离心管倒置滤纸上干燥,用800μl浓度 70 %冰乙醇清洗沉淀两次,以除去盐离子等;

加入800μl浓度 70 %冰乙醇后,轻轻颠倒离心管几次,将沉淀于底部的DNA弹起,放置离心管10 min,4℃10000 rpm离心1 min,弃上清;再用800μl 浓度70 %冰乙醇洗DNA沉淀,方法同上,4℃15000 rpm离心3 min,弃上清,风干去除乙醇;

⑥向⑤中所得DNA沉淀中加入200μl TE溶解DNA沉淀;

待充分溶解后,加入3 μl RNase(10 mg/ml),37℃水浴30 min;然后按③-⑤步相同处理方法进行处理;

⑦将第⑥步处理后的干燥DNA沉淀,用100 μl TE溶解,-20℃保存备用。

5.根据权利要求3所述的油菜茎基溃疡病菌分子标准样品的制备方法,其特征是:对标准样品定性鉴定,通过特异性引物进行PCR扩增或测序进行定性分析,来确认所制备的核酸为目的DNA:

    取制备的核酸标准样品,加入50μlTE,溶解后作为模板使用,经采用特异性引物PhomⅠ和PhomⅡ进行PCR并测序,进行定性分析,确认所制备的核酸标准样品为目的核酸样品,

正向引物: 5'- CACCAATTGGATCCCCTA -3'

              反向引物: 5'- AGGCGAGTCCCAAGTGGAACA -3'

反应体系:

              模板        1~2 μl

              正向引物    1 μl

              反向引物    1 μl

              Taq酶       0.2U

              dNTP         4 μl

              10×Buffer   3 μl

              Total        30 μl

反应条件:

      94℃ 3min

94℃ 30s

53℃ 30s

72℃ 40s   循环35次

72℃ 5min。

6.根据权利要求3所述的油菜茎基溃疡病菌分子标准样品的制备方法,其特征是:所述提取油菜茎基溃疡病菌DNA中采用的氯仿:异戊醇混合液体积比为24:1。

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