[发明专利]油菜茎基溃疡病菌分子标准样品及其制备方法无效
申请号: | 201110219707.8 | 申请日: | 2011-08-02 |
公开(公告)号: | CN102277430A | 公开(公告)日: | 2011-12-14 |
发明(设计)人: | 李鑫;刘冉;曹际娟;王有福 | 申请(专利权)人: | 李鑫;刘冉;曹际娟;王有福 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/10;C12R1/645 |
代理公司: | 大连星海专利事务所 21208 | 代理人: | 于忠晶 |
地址: | 116001 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 油菜 溃疡 病菌 分子 标准 样品 及其 制备 方法 | ||
1.油菜茎基溃疡病菌分子标准样品,其特征在于:以油菜茎基溃疡病菌菌株提取高纯度DNA为原料制得,标准样品具有下述的理化性质:(1)形状:纯白色粉末状;(2)每管的含量5μg ±0.5μg;(3)DNA纯度:OD260/280=1.8~2;(4)易溶于水,或TE(Tris-EDTA)缓冲液中。
2.根据权利要求1所述的油菜茎基溃疡病菌分子标准样品,其特征在于:DNA纯度:OD260/280=1.85。
3.油菜茎基溃疡病菌分子标准样品的制备方法,其特征是:包括如下步骤:
(1)油菜茎基溃疡病菌菌株采用马铃薯蔗糖(PD)液体培养基,置于20~22℃条件下培养5~7天;
(2)提取油菜茎基溃疡病菌DNA,采用CTAB方法提取DNA;
(3)核酸标准样品的制备:将测定浓度后的DNA按5μg±0.5μg /管进行分装,每种核酸分子标样分装100-400管,然后冻干,即为目的标准品。
4.根据权利要求1所述的油菜茎基溃疡病菌分子标准样品的制备方法,其特征是:所述提取油菜茎基溃疡病菌DNA,包括如下步骤:
①取0.1 g干菌丝置于预冷的研钵中,在液氮中迅速研磨成粉末状,把粉末迅速转入1.5 ml 的离心管中;
②向①中装有干菌丝粉末的离心管中加入800 μl 65℃预热的CTAB提取缓冲液,涡旋振荡充分混匀,65℃水浴50 min,每隔 10 min轻轻颠倒混匀一次;
③冷却至室温,再向②中离心管加入800μl的氯仿:异戊醇混合液,轻轻颠倒混匀,静置10 min,4℃10000 rpm离心10 min,取上清;
④向③中所得上清液中加入与该上清液等体积的氯仿:异戊醇混合液,轻轻颠倒混匀,静置10 min,4℃10000 rpm离心10 min,取上清;
⑤向④中所得上清液中加入与该上清液等体积的异丙醇或2倍体积冰无水乙醇,轻轻颠倒混匀,出现DNA絮状沉淀,放在冰上放置30 min沉淀DNA,4℃12000 rpm离心10 min,弃上清,离心管倒置滤纸上干燥,用800μl浓度 70 %冰乙醇清洗沉淀两次,以除去盐离子等;
加入800μl浓度 70 %冰乙醇后,轻轻颠倒离心管几次,将沉淀于底部的DNA弹起,放置离心管10 min,4℃10000 rpm离心1 min,弃上清;再用800μl 浓度70 %冰乙醇洗DNA沉淀,方法同上,4℃15000 rpm离心3 min,弃上清,风干去除乙醇;
⑥向⑤中所得DNA沉淀中加入200μl TE溶解DNA沉淀;
待充分溶解后,加入3 μl RNase(10 mg/ml),37℃水浴30 min;然后按③-⑤步相同处理方法进行处理;
⑦将第⑥步处理后的干燥DNA沉淀,用100 μl TE溶解,-20℃保存备用。
5.根据权利要求3所述的油菜茎基溃疡病菌分子标准样品的制备方法,其特征是:对标准样品定性鉴定,通过特异性引物进行PCR扩增或测序进行定性分析,来确认所制备的核酸为目的DNA:
取制备的核酸标准样品,加入50μlTE,溶解后作为模板使用,经采用特异性引物PhomⅠ和PhomⅡ进行PCR并测序,进行定性分析,确认所制备的核酸标准样品为目的核酸样品,
正向引物: 5'- CACCAATTGGATCCCCTA -3'
反向引物: 5'- AGGCGAGTCCCAAGTGGAACA -3'
反应体系:
模板 1~2 μl
正向引物 1 μl
反向引物 1 μl
Taq酶 0.2U
dNTP 4 μl
10×Buffer 3 μl
Total 30 μl
反应条件:
94℃ 3min
94℃ 30s
53℃ 30s
72℃ 40s 循环35次
72℃ 5min。
6.根据权利要求3所述的油菜茎基溃疡病菌分子标准样品的制备方法,其特征是:所述提取油菜茎基溃疡病菌DNA中采用的氯仿:异戊醇混合液体积比为24:1。
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