[发明专利]一种PTPN11基因突变检测特异性引物和液相芯片有效
申请号: | 201110269795.2 | 申请日: | 2011-09-13 |
公开(公告)号: | CN102994621A | 公开(公告)日: | 2013-03-27 |
发明(设计)人: | 许嘉森;何嘉英 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香;曾旻辉 |
地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 ptpn11 基因突变 检测 特异性 引物 芯片 | ||
1.一种PTPN11基因突变检测液相芯片,其特征是,包括有:
(A).针对PTPN11基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物:每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列为:针对G60V位点的SEQ ID NO.24以及SEQ ID NO.25;针对D61Y/V位点的SEQ IDNO.26以及选自SEQ ID NO.27和SEQ ID NO.28中的一条以上;针对E69K位点的SEQ IDNO.29及SEQ ID NO.30;针对A72T/D位点的SEQ ID NO.31以及选自SEQ ID NO.32和SEQ IDNO.33中的一条以上;针对T73I位点的SEQ ID NO.34及SEQ ID NO.35;针对E76K/Q/A/G/V位点的SEQ ID NO.36以及选自SEQ ID NO.37、SEQ ID NO.38、SEQ ID NO.39、SEQ ID NO.40和SEQ ID NO.41中的一条以上;针对S502P位点的SEQ ID NO.42及SEQ ID NO.43;和/或针对G503A/V位点的SEQ ID NO.44以及选自SEQ ID NO.45和SEQ ID NO.46中的一条以上;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.23;
(B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.47~SEQ ID NO.69,且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对;
(C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物。
2.根据权利要求1所述的PTPN11基因突变检测液相芯片,其特征是,所述扩增引物为:针对G60V、D61Y/V、E69K、A72T/D、T73I、E76K/Q/A/G/V位点的SEQ ID NO.70~SEQ ID NO.71;和/或针对S502P、G503A/V位点的SEQ ID NO.72~SEQ ID NO.73。
3.根据权利要求1所述的PTPN11基因突变检测液相芯片,其特征是,所述ASPE引物为:针对G60V位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.24组成的序列以及SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.25组成的序列;针对D61Y/V位点的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.26组成的序列以及选自由SEQID NO.4和SEQ ID NO.27组成的序列、由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.28组成的序列中的一条以上;针对E69K位点的由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.29组成的序列及由SEQ ID NO.7和SEQ IDNO.30组成的序列;针对A72T/D位点的由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.31组成的序列及选自由SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.32组成的序列、由SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.33组成的序列中的一条以上;针对T73I位点的由SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.34组成的序列及由SEQ ID NO.12和SEQ ID NO.35组成的序列;针对E76K/Q/A/G/V位点的由SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.36组成的序列及选自由SEQ ID NO.14和SEQ ID NO.37组成的序列、由SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.38组成的序列、由SEQ ID NO.16和SEQ ID NO.39组成的序列、由SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.40组成的序列、由SEQ ID NO.18和SEQ ID NO.41组成的序列中的一条以上;针对S502P位点的由SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.42组成的序列及由SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.43组成的序列;和/或针对G503A/V位点的由SEQ ID NO.21和SEQ ID NO.44组成的序列及选自由SEQ IDNO.22和SEQ ID NO.45组成的序列、由SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.46组成的序列中的一条以上。
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