[发明专利]用于鉴别水稻籼亚种生态型的引物组合物及其应用无效
申请号: | 201110271841.2 | 申请日: | 2011-09-14 |
公开(公告)号: | CN102296123A | 公开(公告)日: | 2011-12-28 |
发明(设计)人: | 李自超;张冬玲;张洪亮;王美兴;王凤梅;宋立莹;马占峰 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鉴别 水稻 籼亚种 生态型 引物 组合 及其 应用 | ||
技术领域
本发明涉及一种用于鉴别水稻籼亚种生态型的引物组合物及其应用。
背景技术
水稻(Oryza sativa L.)是世界上最重要的粮食作物之一。中国作为亚洲栽培稻的起源地之一(Oka 1988),拥有丰富的稻种资源。目前,国家种质资源库收集保存栽培稻7万余份,其中籼稻种质资源占67%(ICGR CAAS 1996)。我国籼稻种植面积占水稻总面积的70%,而且,籼稻是实现杂交化程度最高的水稻,杂交籼稻种植面积已占中国籼稻面积的近80%。因此,籼稻在我国水稻研究和生产实践中具有重要的地位。
栽培稻的分类一直受到各国科学家的高度重视,国内外学者相继提出了多种分类体系。籼、粳是亚洲栽培稻遗传分化的主流,已有了比较一致的认识。每个亚种内的遗传分化及分类却一直没有一致的意见。
进入20世纪80年代以来,我国杂交稻产量徘徊不前,其中最主要的原因是亲本的遗传基础狭窄,而拓宽杂交稻亲本间的遗传差异,可以在一定程度上提高组合的优势强度。然而,根据不同地区的生态条件所划分的生态类型无法有效反映亲本间的遗传差异,对杂种优势的预测效果不理想。另外,水稻中籼、粳亚种间杂种优势的利用已得到广泛的关注,但是,由于存在F1代半不育等诸多问题,亚种间杂种优势一直难以直接利用,亚种内不同生态类型间的杂种优势利用已成为育种家的共识。但是,有关合理、可行的亚种内生态型的划分研究较少。
亚种内不同生态型间杂种优势的利用已成为杂交稻进入更高发展阶段,开展超高产育种的一个主要方向。要进行籼稻亚种内不同生态型间杂种优势的超高产育种,首先要正确判别能够反映品种间遗传差异的生态型。然而,大量育成品种由于广泛杂交而具有复杂的血缘,对这些品种的分类是栽培稻分类的新任务。
发明内容
本发明的目的是提供一种用于鉴别水稻籼亚种生态型的引物组合物及其应用。
本发明提供的辅助鉴别水稻籼亚种生态型的引物组合物,由rm216引物对、rm225引物对、rm235引物对、rm25引物对、rm23引物对、rm244引物对、rm253引物对、rm267引物对、rm296引物对、rm223引物对和rm258引物对组成;
所述rm216引物对为序列表的序列1所示DNA(上游引物)和序列表的序列2所示DNA(下游引物)组成的引物对;所述rm225引物对为序列表的序列3所示DNA(上游引物)和序列表的序列4所示DNA(下游引物)组成的引物对;所述rm235引物对为序列表的序列5所示DNA(上游引物)和序列表的序列6所示DNA(下游引物)组成的引物对;所述rm25引物对为序列表的序列7所示DNA(上游引物)和序列表的序列8所示DNA(下游引物)组成的引物对;所述rm23引物对为序列表的序列9所示DNA(上游引物)和序列表的序列10所示DNA(下游引物)组成的引物对;所述rm244引物对为序列表的序列11所示DNA(上游引物)和序列表的序列12所示DNA(下游引物)组成的引物对;所述rm253引物对为序列表的序列13所示DNA(上游引物)和序列表的序列14所示DNA(下游引物)组成的引物对;所述rm267引物对为序列表的序列15所示DNA(上游引物)和序列表的序列16所示DNA(下游引物)组成的引物对;所述rm296引物对为序列表的序列17所示DNA(上游引物)和序列表的序列18所示DNA(下游引物)组成的引物对;所述rm223引物对为序列表的序列19所示DNA(上游引物)和序列表的序列20所示DNA(下游引物)组成的引物对;所述rm258引物对为序列表的序列21所示DNA(上游引物)和序列表的序列22所示DNA(下游引物)组成的引物对。
所述水稻籼亚种生态型可为早籼生态型、中间型生态型或晚籼生态型。
所述引物组合物中的每条引物在合成时,可以引入各种标记,如荧光标记。
所述引物组合物可用于辅助鉴别水稻籼亚种生态型。所述水稻籼亚种生态型可为早籼生态型、中间型生态型或晚籼生态型。
所述的引物组合物可用于制备辅助鉴别水稻籼亚种生态型的试剂盒。所述水稻籼亚种生态型可为早籼生态型、中间型生态型或晚籼生态型。
本发明还保护一种辅助鉴别水稻籼亚种生态型的试剂盒,含有所述引物组合物。所述水稻籼亚种生态型可为早籼生态型、中间型生态型或晚籼生态型。所述试剂盒中,还可包括用于提取基因组DNA的试剂和/或用于PCR扩增的试剂。所述试剂盒中的各个组分可为液体,也可为冻干粉。
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