[发明专利]EGFR基因的多态性检测用探针、扩增用引物及其应用有效

专利信息
申请号: 201110348377.2 申请日: 2011-10-31
公开(公告)号: CN102559866A 公开(公告)日: 2012-07-11
发明(设计)人: 井口亚希;伊集院萌子 申请(专利权)人: 爱科来株式会社
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258 代理人: 肖善强
地址: 日本*** 国省代码: 日本;JP
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摘要:
搜索关键词: egfr 基因 多态性 检测 探针 扩增 引物 及其 应用
【权利要求书】:

1.多态性检测用探针,所述探针是能检测EGFR基因的突变的探针,其特征在于所述探针包括选自下述P1、P3、P5~P7以及P15~P18中的至少一种经荧光标记的寡核苷酸:

(P1)寡核苷酸,其具有与含有序列编号1所示的碱基序列中碱基编号251~261的11~50个碱基长的碱基序列互补的序列或与所述互补的序列具有同源性的序列,其中,与碱基编号261对应的碱基为腺嘌呤或胞嘧啶,与碱基编号251对应的碱基为胞嘧啶,所述胞嘧啶被荧光色素标记;

(P3)寡核苷酸,其具有与含有序列编号1所示的碱基序列中碱基编号257~261的5~50个碱基长的碱基序列互补的序列或与所述互补的序列具有同源性的序列,其中,与碱基编号261对应的碱基为腺嘌呤或胞嘧啶,与碱基编号257对应的碱基为胞嘧啶,所述胞嘧啶被荧光色素标记;

(P5)寡核苷酸,其具有与含有序列编号2所示的碱基序列中碱基编号104~112的9~50个碱基长的碱基序列具有同源性的序列,其中,与碱基编号112同源的碱基为胸腺嘧啶,与碱基编号104同源的碱基为胞嘧啶,所述胞嘧啶被荧光色素标记;

(P6)寡核苷酸,其具有与含有序列编号2所示的碱基序列中碱基编号104~119的16~50个碱基长的碱基序列具有同源性的序列,其中,碱基编号119的碱基被G以外的碱基替换,与碱基编号104同源的碱基为胞嘧啶,所述胞嘧啶被荧光色素标记;

(P7)寡核苷酸,其具有与含有序列编号3所示的碱基序列中碱基编号136~145的10~50个碱基长的碱基序列具有同源性的序列,其中,与碱基编号145同源的碱基为胞嘧啶,所述胞嘧啶被荧光色素标记;

(P15)寡核苷酸,其具有与含有序列编号1所示的碱基序列中碱基编号259~264的6~50个碱基长的碱基序列互补的序列或与所述互补的序列具有同源性的序列,其中,与碱基编号261对应的碱基为腺嘌呤或胞嘧啶,位于所述碱基3’侧的胞嘧啶被荧光色素标记;

(P16)寡核苷酸,其具有与含有序列编号1所示的碱基序列中碱基编号258~262的5~50个碱基长的碱基序列互补的序列或与所述互补的序列具有同源性的序列,其中,与碱基编号261对应的碱基为腺嘌呤或胞嘧啶,位于所述碱基5’侧的胞嘧啶被荧光色素标记;

(P17)寡核苷酸,其具有与含有序列编号1所示的碱基序列中碱基编号249~264的16~50个碱基长的碱基序列具有同源性的序列,其中,与碱基编号261同源的碱基为胸腺嘧啶或鸟嘌呤,位于所述碱基5’侧的胞嘧啶被荧光色素标记;

(P18)寡核苷酸,其具有与含有序列编号1所示的碱基序列中碱基编号257~264的8~50个碱基长的碱基序列具有同源性的序列,其中,与碱基编号261同源的碱基为胸腺嘧啶或鸟嘌呤,位于所述碱基3’侧的胞嘧啶被荧光色素标记。

2.如权利要求1所述的探针,其中:

P1的寡核苷酸在3’末端起算第1~3位的位置上具有经荧光色素标记的对应于碱基编号251的碱基;

P3的寡核苷酸在3’末端起算第1~3位的位置上具有经荧光色素标记的对应于碱基编号257的碱基;

P5的寡核苷酸在5’末端起算第1~3位的位置上具有经荧光色素标记的与碱基编号104同源的碱基;

P6的寡核苷酸在5’末端起算第1~3位的位置上具有经荧光色素标记的与碱基编号104同源的碱基;

P7的寡核苷酸在3’末端起算第1~3位的位置上具有经荧光色素标记的与碱基编号145同源的碱基;

P15的寡核苷酸在3’末端起算第1~3位的位置上具有所述经荧光色素标记的胞嘧啶;

P16的寡核苷酸在5’末端起算第1~3位的位置上具有所述经荧光色素标记的胞嘧啶;

P17的寡核苷酸在5’末端起算第1~3位的位置上具有所述经荧光色素标记的胞嘧啶;

P18的寡核苷酸在3’末端起算第1~3位的位置上具有所述经荧光色素标记的胞嘧啶。

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