[发明专利]一种拟南芥根特异性表达基因ARSK1启动子的克隆方法有效
申请号: | 201110359401.2 | 申请日: | 2011-11-11 |
公开(公告)号: | CN102417904A | 公开(公告)日: | 2012-04-18 |
发明(设计)人: | 吴忠义;黄丛林;张秀海;罗昌;程曦 | 申请(专利权)人: | 北京农业生物技术研究中心 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12N15/113 |
代理公司: | 北京国林贸知识产权代理有限公司 11001 | 代理人: | 李桂玲;孔祥玲 |
地址: | 100097 北京市海淀*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 拟南芥 特异性 表达 基因 arsk1 启动子 克隆 方法 | ||
1.一种拟南芥根特异性表达基因ARSK1启动子的克隆方法,其特征在于:该方法包括以下步骤:
Ⅰ、获取拟南芥根特异性基因ARSK1:
A、分别从拟南芥植株中提取拟南芥根总RNA和拟南芥叶总RNA,再分别进行反转录PCR反应,分别扩增得到拟南芥根cNDA序列和拟南芥叶cNDA序列;
B、分别以所述的拟南芥根cNDA序列和拟南芥叶cNDA序列为模板,分别根据拟南芥根特异性基因设计引物,再分别进行半定量PCR反应,筛选得到拟南芥根特异性基因ARSK1;
Ⅱ、获取拟南芥根特异性表达基因ARSK1启动子:
A、在线分析得到拟南芥根特异性表达基因ARSK1的启动子,再在拟南芥根DNA中进行克隆得到所述的拟南芥根特异性表达基因ARSK1启动子。
2.根据权利要求1所述的拟南芥根特异性表达基因ARSK1启动子的克隆方法,其特征在于:
步骤Ⅰ-B中所述的拟南芥根特异性基因在拟南芥信息资源网站的编号分别为:AT1G79580.1、AT1G62980.1、AT1G66470.1、AT1G27740.1、AT1G54970.1、AT3G10710.1、AT1G12560.1、AT2G26420.1、AT1G12040.1、AT1G62440.1、AT3G62680.1、AT2G26290.1。
3.根据权利要求1所述的拟南芥根特异性表达基因ARSK1启动子的克隆方法,其特征在于:所述的拟南芥根特异性表达基因ARSK1启动子的序列为SEQ ID No:1。
4.根据权利要求1所述的拟南芥根特异性表达基因ARSK1启动子的克隆方法,其特征在于:
在步骤Ⅱ之后,进行所述的拟南芥根特异性表达基因ARSK1启动子功能验证,包括以下步骤:
A、在线分析得到所述的拟南芥根特异性表达基因ARSK1启动子的转录起始位点、含有的顺势作用元件;
B. 将所述的拟南芥根特异性表达基因ARSK1启动子进行5’端缺失处理,经过PCR反应得到ARSK1启动子缺失体片段;
C. 将所述的ARSK1启动子缺失体片段分别构建ARSK1启动子缺失体GUS表达载体;
D、将所述的ARSK1启动子缺失体GUS表达载体转化拟南芥植株,得到转化体植株,再进行检测。
5.根据权利要求4所述的拟南芥根特异性表达基因ARSK1启动子的克隆方法,其特征在于:所述的ARSK1启动子缺失体片段的大小分别为
1981bp, 1460bp, 879bp, 762bp, 409bp,358 bp。
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