[发明专利]甘蔗GH32家族可溶性酸性转化酶(SoINV)基因及其蛋白序列无效
申请号: | 201110365748.8 | 申请日: | 2011-11-17 |
公开(公告)号: | CN102505021A | 公开(公告)日: | 2012-06-20 |
发明(设计)人: | 王爱勤;牛俊奇;刘铭;杨丽涛;李杨瑞 | 申请(专利权)人: | 广西大学 |
主分类号: | C12N15/56 | 分类号: | C12N15/56;C12N15/10;C12N9/24 |
代理公司: | 广西南宁汇博专利代理有限公司 45114 | 代理人: | 邹超贤 |
地址: | 530004 广西*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 甘蔗 gh32 家族 可溶性 酸性 转化 soinv 基因 及其 蛋白 序列 | ||
1.一种甘蔗GH32家族可溶性酸性转化酶(SoINV)基因及其蛋白序列,其特征在于:对所有植物可溶性酸性转化酶基因全长序列进行进化分析的基础上,比对同一家族的可溶性酸性转化酶基因cDNA序列,并设计扩增SoINV基因核心片段的引物,从甘蔗幼嫩叶片提取总RNA,并经反转录,用常规PCR法扩增SoINV基因核心片段;然后在核心片段序列5′端设计若干对特异引物,在核心片段序列3′端设计一个特异引物和两个锚定引物,通过RACE PCR技术分别扩增到SoINV基因核心区的5′端三个不同序列片段和3′端一个序列片段,将三个5′端序列分别与核心区、3′端序列和AY302083片段进行拼接,获得甘蔗GH32家族三个可溶性酸性转化酶(SoINV)基因全长cDNA序列,分别记为SoINV1、SoINV2和SoINV3。
2.根据权利要求1所述的甘蔗GH32家族可溶性酸性转化酶(SoINV)基因及其蛋白序列,其特征在于:所述的SoINV1总长2387bp;经Vector NTI Advance 11软件分析,该序列的ORF为2055bp,编码685个氨基酸;起始密码子(ATG)位于转录起始位点后215bp处,终止密码子(TAG)位于2272bp,其后还有一段115bp的非编码序列,并带有真核生物典型的polyA尾巴;甘蔗GH32家族SoINV1基因所编码蛋白的氨基酸序列:
METRDTTAPLPYSYTPLPAADAASAEVTGTGGRSRRRSLCAAALVLSAALLLAVAALAAAGRRPTTAVGETAGVGVVPGVGTPQATSTRSISRGPDAGVSEKTSGAWSGVVDDGGRLRADGGGNAFPWSNAMLQWQRTGFHFQPQRNWMNDPNGPVYYKGWYHLFYQYNPDGAIWGNKIAWGHAVSRDLIHWRHLPLAMLPDQWYDTNGVWTGSATTLPDGRLAMLYTGSTNTSVQVQCLAVPADDDDPLLTNWTKYEGNPALYPPPGIGPRDFRDPTTAWFDPSDSTWRIVIGSKDDAEGDHAGIAVVYRTRDFVHFELLPDLLHRVAGTGMWECIDFYPVATRGKASGNGVDMSDALAKNGAVVGDVVHVMKASMDDDRHDYYALGRYDAAANAWTPLDAEKDVGTGLRYDWGKFYASKTFYDPAKRRRVLWGWVGETDSERADVSKGWASLQGIPRTVLLDTKTGSNLLQWPVEEVETLRTNSTDLSGITIDYGSTFPLNLRRATQLDIEAEFELDRRAVMSLNEADVGYNCSTSGGAAARGALGPFGLLVLTDKHLHEQTAVYFYVAKGLDGSLTTHFCQDESRSSSANDIVKRVVGSAVPVLEDETTLSLRVLVDHSIVESFAQGGRSTATSRVYPTKAIYANAGVFLFNNATAARVTAKKLVVHEMDSSYNHDYMVTDI。
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