[发明专利]抗结核抑制剂筛选的靶标基因Rv2780及应用有效
| 申请号： | 201110373810.8 | 申请日： | 2011-11-21 |
| 公开（公告）号： | CN103123671A | 公开（公告）日： | 2013-05-29 |
| 发明（设计）人： | 何正国;曾菊梅;崔涛 | 申请（专利权）人： | 华中农业大学 |
| 主分类号： | G06F19/16 | 分类号： | G06F19/16 |
| 代理公司： | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人： | 张红兵 |
| 地址： | 430070 湖*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 结核 抑制剂 筛选 靶标 基因 rv2780 应用 | ||
1.结核分枝杆菌基因Rv2780在筛选抗结核抑制剂靶标中的应用，其特征在于，该基因的核苷酸序列如序列表SEQ.ID NO：1所示。
2.结核分枝杆菌基因Rv2780在筛选抗结核抑制剂靶标中的应用，其特征在于，该基因编码的蛋白质的序列如序列表SEQ.ID NO：2所示。
3.如权利要求1或2所述的一种结核分枝杆菌Rv2780基因作为药物靶标的应用，其特征在于包含以下步骤：
(1)从PBD蛋白质数据库获得结核分枝杆菌Rv2780蛋白质结构，以Rv2780结合NADH的活性空腔为其活性位点；
(2)建立针对结核分枝杆菌Rv2780的计算机药物筛选系统；
(3)运用步骤(2)的计算机药物筛选系统针对结核分枝杆菌Rv2780蛋白质活性位点，从ZINC数据库中筛选出15个与结核分枝杆菌Rv2780活性位点有高亲和力的化合物；
(4)利用小分子化合物进行抑菌试验，测定有抑菌活性的小分子的最小抑菌浓度；
其中：
步骤(1)中的结核分枝杆菌Rv2780蛋白质的序列如序列表SEQ IDNO：2所示；
步骤(3)的15个与结核分枝杆菌Rv2780活性位点有高亲和力的化合物如下所述，且具有以下特征：
化合物21#
英文名称：3-(acetylamino)benzenesulfonic acid
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC02027551；
化合物22#
英文名称：3-(formyloxy)pyridine-2-carboxylic acid
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00335084；
化合物23#
英文名称：3-azidothiophene-2-carboxylic acid
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC08383145；
化合物24#
英文名称：3-imino-2-thien-2-ylpropanoic acid
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC20032425；
化合物25#
英文名称：4-(allylsulfanyl)-1H-imidazo[4，5-d]pyridazin-7-yl hydrosulfide
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC05824465；
化合物26#
英文名称：2-formyl-6-methoxybenzoic acid
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC02524510；
化合物27#
英文名称：6-amino-2-hydroxypyrimidine-4-sulfonic acid
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC19800905；
化合物28#
英文名称：5-(allyloxy)-6-bromo-2-pyridinecarboxylic acid
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC19872949；
化合物29#
英文名称：3-oxo-1，3-dihydro-2-benzofuran-1-carboxylic acid
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00336769；
化合物30#
英文名称：5-chloro-1，3-benzodioxole-4-carboxylic acid
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC05046731；
化合物31#
英文名称：6-bromo-5-hydroxy-2-pyridinecarboxylic acid
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC19924559；
化合物32#
英文名称：4-cinchomeronic acid-amide
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00967289；
化合物33#
英文名称：4-bromo-5-methoxy-2-thiophenecarboxylic acid
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00334118；
化合物34#
英文名称：N-(1H-1，2，4-triazol-3-ylcarbonyl)-beta-alanine
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC19871583；
化合物35#
英文名称：6-amino-5-chloropyridine-3-sulfonic acid
结构式：
化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC19862909；
其中
步骤(4)测定有抑菌活性的小分子化合物22#的最小抑菌浓度分别如下：
结核分枝杆菌 4μg/ml；
牛结核分枝杆菌 8μg/ml；
步骤(4)测定有抑菌活性的小分子化合物即抑制剂23#的最小抑菌浓度分别如下：
结核分枝杆菌 0.5μg/ml；
牛结核分枝杆菌 1μg/ml。
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