[发明专利]多态性检测用探针、多态性检测方法、药效评价方法及多态性检测用试剂盒无效
申请号: | 201110425525.6 | 申请日: | 2011-10-28 |
公开(公告)号: | CN102453766A | 公开(公告)日: | 2012-05-16 |
发明(设计)人: | 黑瀬熏 | 申请(专利权)人: | 爱科来株式会社 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258 | 代理人: | 肖善强 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 多态性 检测 探针 方法 药效 评价 试剂盒 | ||
1.MRD1基因的多态性检测用探针,其包含选自包括下述P1寡核苷酸及P2寡核苷酸的组中的至少一种荧光标记寡核苷酸:
(P1)寡核苷酸,其具有与序列号2所示的碱基序列中包含第288~300位的碱基的碱基长为13~68的第一碱基序列互补的序列或与该互补序列同源的序列,所述寡核苷酸中与第288位的碱基互补的碱基用第一荧光染料标记,
(P2)寡核苷酸,其具有与序列号2所示的碱基序列中包含第300~305位的碱基的碱基长为6~93的第二碱基序列互补的序列或与该互补序列同源的序列,所述寡核苷酸中与第305位的碱基互补的碱基用第二荧光染料标记。
2.如权利要求1所述的多态性检测用探针,其中,所述P1寡核苷酸在从所述P1寡核苷酸的3’末端起数第1~3位中的任意位置具有用所述第一荧光染料标记的碱基,
所述P2寡核苷酸在从所述P2寡核苷酸的5’末端起数第1~3位中的任意位置具有用所述第二荧光染料标记的碱基。
3.如权利要求1所述的多态性检测用探针,其中,所述P1寡核苷酸在所述P1寡核苷酸的3’末端具有用所述第一荧光染料标记的碱基,
所述P2寡核苷酸在所述P2寡核苷酸的5’末端具有用所述第二荧光染料标记的碱基。
4.如权利要求1所述的多态性检测用探针,其中,所述荧光标记寡核苷酸与目标序列杂交时的荧光强度比未和目标序列杂交时的荧光强度小或大。
5.如权利要求1所述的多态性检测用探针,其中,所述荧光标记寡核苷酸与目标序列杂交时的荧光强度比未和目标的序列杂交时的荧光强度小。
6.如权利要求1所述的多态性检测用探针,其中,所述P1寡核苷酸的碱基长为13~56,所述P2寡核苷酸的碱基长为6~29。
7.如权利要求1所述的多态性检测用探针,其中,所述P1寡核苷酸的碱基长为13~26,所述P2寡核苷酸的碱基长为6~23。
8.如权利要求1所述的多态性检测用探针,其中,所述P1寡核苷酸的碱基长为13~21,所述P2寡核苷酸的碱基长为6~18。
9.如权利要求1所述的多态性检测用探针,其中,所述探针为用于解链曲线分析的探针。
10.如权利要求1所述的多态性检测用探针,其中,所述探针包含下述至少两种荧光标记寡核苷酸,所述至少两种荧光标记寡核苷酸中与序列号2所示的碱基序列的第300位的碱基互补的碱基互不相同且所述互补的碱基为C、T或A。
11.MDR1基因的多态性检测方法,其中,所述方法包括使用权利要求1~10中任一项所述的多态性检测用探针。
12.如权利要求11所述的多态性检测方法,所述方法包括:
(I)使所述多态性检测用探针和试样中的单链核酸接触,使所述荧光标记寡核苷酸和所述单链核酸杂交而得到杂交体;
(II)通过改变包含所述杂交体的所述试样的温度,使所述杂交体解离,测定基于所述杂交体的解离的荧光信号的变动;
(III)基于所述荧光信号的变动,评价杂交体的解离温度的Tm值;和
(IV)基于所述Tm值,确认MDR1基因的多态性的存在。
13.如权利要求11所述的多态性检测方法,还包括得到所述单链核酸的步骤,所述得到单链核酸的步骤包括在所述(1)之前或与(1)同时扩增核酸。
14.如权利要求11所述的多态性检测方法,还包括使能够检测序列号1所示的碱基序列的第256位的碱基的突变的多态性检测用探针与所述试样中的所述单链核酸接触。
15.如权利要求14所述的多态性检测方法,其中,所述能够检测序列号1所示的碱基序列的第256位的碱基的突变的多态性检测用探针为:具有与序列号1所示的碱基序列中从第248位的碱基开始9~50个碱基长的碱基序列互补的碱基序列的荧光标记寡核苷酸。
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