[发明专利]一种检测禽流感病毒通用亚型的液相芯片方法有效
申请号: | 201110445020.6 | 申请日: | 2011-12-27 |
公开(公告)号: | CN102433395A | 公开(公告)日: | 2012-05-02 |
发明(设计)人: | 王慧煜;韩雪清;林祥梅;梅琳 | 申请(专利权)人: | 中国检验检疫科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王朋飞;王加岭 |
地址: | 100123 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 禽流感 病毒 通用 芯片 方法 | ||
1.一种用液相芯片方法检测禽流感病毒通用亚型的引物,其核苷酸序列为:
M-FP:5’-CAAGACCAATCCTGTCACCT-3’,
M-RP:5’-GGGTCTCCATTCCCATTTAG-3’,在M-RP引物的5’端用生物素标记。
2.一种用液相芯片方法检测禽流感病毒通用亚型的探针,其核苷酸序列为:5’-GTGAGCGAGGACTGCAGCGTAG-3’,在其5’端用氨基修饰。
3.一种液相芯片,其特征在于,是权利要求2所述的特异性检测探针与荧光标记微球偶联制成的特异性检测微球。
4.一种用液相芯片检测禽流感病毒通用亚型的方法,其特征在于,用权利要求1所述的引物,对样品RNA进行RT-PCR反应,将带生物素标记的RT-PCR产物与权利要求3所述的液相芯片进行分子杂交后,检测荧光值,确定样品中是否含有禽流感病毒。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,包括下列步骤:
1)提取样本中禽流感病毒RNA;
2)以步骤1)提取的样本RNA为模板,以权利要求1所述的引物进行RT-PCR反应;
3)将权利要求2所述的探针与荧光标记微球偶联;
4)杂交:将带有生物素标记的步骤2)中的RT-PCR产物与步骤3)中的偶联到荧光微球上的探针在PCR仪上杂交;
5)检测荧光值,以平均荧光值大于100且为空白对照3倍以上荧光值所对应的检测标本为阳性。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤2)的RT-PCR反应50μL反应体系为:一步法RT-PCR 5×buffer 10.0μL,10mmol/LdNTP 2.0μL,酶混合物2.0μL,RNA酶抑制剂0.5μL,RNA模板5.0μL,10μmol/L上游引物0.5μL,10μmol/L下游引物1.0μL,不含RNA酶的ddH2O 29.0μL;RT-PCR反应条件为:50℃30min;95℃15min,94℃30s,52℃40s,72℃1min,共35个循环;72℃10min。
7.如权利要求5所述的方法,其特征在于,其中步骤3)中每1.25×106个荧光微球加入浓度为0.1nmol/μL的特异性探针4μL。
8.如权利要求5所述的方法,其特征在于,其中步骤4)采用以下方法进行杂交:杂交体系为50μL,其中微球33μL,步骤2)中的PCR产物为5μL,加入TE补充体积至50μL;杂交条件为:95℃变性5min后,50℃杂交30min。
9.一种试剂盒,其特征在于,含有特异性检测探针,其序列为:5’-GTGAGCGAGGACTGCAGCGTAG-3’,在其5’端用氨基修饰。
10.权利要求3所述的液相芯片和权利要求9所述的试剂盒在检测禽流感病毒通用亚型中的应用。
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