[发明专利]肠杆菌638及其应用方法

说明书

相关申请的参考

本申请要求于2010年3月12日提交的美国临时专利申请NO.61/313,415的权益，该专利申请在此全部引用作为参考。

本发明在政府的支持下完成，合同号DE-AC02-98CH10886，其由美国能源部颁发。政府具有本发明中的某些权利。

技术领域

本发明涉及一种新型肠杆菌物种，尤其涉及其与植物生长和发育相关的应用。

背景技术

可以预料地球的气候变化会对农业生产力产生很大影响。例如，化石燃料燃烧造成排放物增加，影响地球气候，这就更需要生产源自可再生资源的生物燃料。气候改变会影响农业生产力的另一个方面是其造成温度升高并对降雨模式造成影响。

虽然期望增加用于生产生物燃料的原料生产中的农业资源需求，但是该增加的需求需与同时增加的用于养活仍在增长的世界人口的食物需求相平衡。

因此，需要实现用于优化粮食生产和生物燃料原料生产的可持续发展。通过可持续方式最佳地提高总植物生产力，提高植物的抗旱性，使得农作物和原料可承受较大波动的降雨模式，并增加植物的耐病原体感染性。

发明内容

一方面，本发明涉及肠杆菌638（杨树内生菌，Enterobacter sp.638）的分离培养物（isolated culture）。

另一方面，本发明涉及用于植物的接种物。该接种物包括肠杆菌638的分离培养物和生物学可接受的基质（medium）。

仍在另一个方面，本发明涉及用于增加植物生长的方法。该方法包括为植物施加（应用，apply）可有效增加植物生长的量的组合物，其中该组合物包括肠杆菌638的分离培养物。

在进一步方面，本发明涉及用于增加植物中的生物量（biomass）的方法。该方法包括为植物施加可有效增加植物中生物量的量的组合物，其中该组合物包括肠杆菌638的分离培养物。

仍在进一步方面，本发明涉及用于提高植物的果实和/或种子生产力（productivity）的方法。该方法包括为植物施加可有效提高植物的果实和/或种子生产力的量的组合物。该组合物包括肠杆菌638的分离培养物。

在其他方面，本发明涉及提高植物抗病性（耐病性，disease tolerance）的方法。该方法包括为植物施加可有效提高植物抗病性的量的组合物。该组合物包括肠杆菌638的分离培养物。

仍在其他方面，本发明涉及提高植物耐旱性的方法。该方法包括为植物施加可有效提高植物抗病性的量的组合物。该组合物包括肠杆菌638的分离培养物。

从以下详述和附图可了解本发明的其他优点和方面。

附图说明

图1为肠杆菌638株的16S系统发育分析（phylogenetic analysis）。

图2为肠杆菌638染色体的圆形表示（环形表示）。圆表示（从外至内）：1000bp窗口中的GC百分偏差（GC窗口-平均GC），顺时针方向上转录的预测CDS，逆时针方向上转录的预测CDS，顺时针和逆时针上根据其COG类进行着色的CDS，所有回文重复位置，100回文重复位置（CCCTCTCCCXX（X）GGGAGAGGG）（SEQ ID NO：1），1000bp窗口中的GC偏移（skew）（G+C/G-C）和千碱基对中的配对物（coordinate）。并示出显示为橙色基因的与大肠杆菌K12比较的共线性区域，显示为紫色基因对应于非共线性区域。箭头表示不与大肠杆菌K12共线的区域中的基因的预测功能（每个区域中有关基因含量的进一步细节见表1）。共线区域定义为存在于细菌基因组序列中并表现出有关其他细菌基因组中相同基因的类似基因组织的至少三个连续基因。

图3为肠杆菌638的质粒pENT638-l的圆形表示法。从外至内圆圈表示为：pENT-01功能组的细分，基因注释，1000bp窗口中的GC百分偏差（GC窗口-平均GC），顺时针方向上转录的预测CDS（红色），逆时针方向上转录的预测CDS（蓝色），1000bp窗口中的GC偏移（G+C/G-C），源自IS元件的转座因子（transposable element）（粉红色）和假基因（灰色）。毒素/抗T毒素（TA）系统用星号表示（^*）。