[发明专利]通过由分子梳检测基因组和感染性病毒DNA的病毒感染的诊断

权利要求书

1.用于检测生物学样品中的感染性病毒多核苷酸的方法，其包括：

自所述样品分离、提取或另外获得多核苷酸，

分子梳所述多核苷酸以形成延伸的多核苷酸，

使所述延伸的多核苷酸与识别感染性多核苷酸序列的一种或更多探针接触，

检测探针与被梳的样品的杂交；由此检测感染性病毒多核苷酸。

2.权利要求1的方法，其中所述生物学样品是自人、非-人哺乳动物或鸟获得的组织样品、细胞、血清、血、CSF或滑液样品。

3.权利要求1或权利要求2的方法，其中所述多核苷酸是自人、非-人哺乳动物或鸟的组织、细胞、血清、血、CSF或滑液样品提取的感染性或非-感染性病毒DNA。

4.权利要求1～3之任一项的方法，其中所述多核苷酸被整合到人或非-人哺乳动物或鸟的DNA或附加体或生物学流体。

5.权利要求1～4之任一项的方法，其中所述多核苷酸用与双DNA链病毒的病毒DNA结合的一种或更多探针检测。

6.权利要求1～5之任一项的方法，其中所述多核苷酸用与疱疹病毒，乳头瘤病毒，肝炎病毒或反转录病毒的DNA结合的一种或更多探针检测。

7.权利要求1～6之任一项的方法，其中所述一种或更多探针包含一组与病毒的至少1kb的基因组DNA结合的探针。

8.权利要求1～7之任一项的方法，其中所述一种或更多探针包含至少2组用选择用于允许鉴定病毒基因组的不同部分或段或重排列的片段的不同标记物标记的探针。

9.权利要求8的方法，其中所述组的探针覆盖5～100%的HSV或HIV基因组。

10.检测或鉴定哺乳动物细胞、组织或生物学流体中的感染性或基因组病毒多核苷酸序列的方法，其包括使用分子梳检测细胞、组织或生物学流体中感染性病毒多核苷酸或基因组病毒多核苷酸的存在或量。

11.定量感染性或基因组病毒多核苷酸序列的方法，其包括使用分子梳检测细胞、组织或生物学流体相比在不同的时间点获得的未感染的对照样品或另外类似样品中的感染性病毒多核苷酸或基因组病毒多核苷酸的量。

12.检测或跟踪哺乳动物细胞中病毒存在或病毒复制或病毒基因组重排的方法，其包括对于细胞、组织或生物学流体中潜伏或复制中的病毒DNA或重排列的病毒DNA的存在实施分子梳。

13.评价抗-病毒治疗的功效的方法，其包括：

使用分子梳检测从受试者获得的样品中感染性或基因组病毒DNA的存在、排列或量，

用抗-病毒剂治疗所述受试者，以及

使用分子梳再评价所述受试者中感染性病毒或基因组病毒DNA的存在、排列或量。

14.权利要求9～12之任一项的方法，其包括实施权利要求1～8之任一项中定义的方法的步骤。

15.一组探针，其覆盖5～100%的HSV或HIV基因组。

16.用于实施分子梳的试剂盒，其包含：

分子梳设备和/或试剂，

用于检测或鉴定被梳的DNA分子中的基因组病毒DNA的与感染性病毒多核苷酸结合的一种或更多探针，以及

任选地一种或更多细胞、组织或生物学流体样品，以及

任选地用于检测或分类感染性序列的软件。

17.生物材料HSV-B4（CNCM I-4298），HSV-B19（CNCM I-4299），HSV-Sc54（CNCM I-4300），或HSV-P4（CNCM I-4301）。