[发明专利]核酸计数

权利要求书

1.测定生物学样品中靶核酸的相对量的方法，所述方法包括：

排列自生物学样品获得的多核苷酸以形成多个反应位点，其中各反应位点含有平均一个多核苷酸；

扩增多个反应位点中的多核苷酸；

由核酸杂交测定（i）含有靶核酸序列、或其部分的第1反应位点的第1数，及（ii）含有参照核酸序列、或其部分的第2反应位点的第2数；

比较第1反应位点的第1数与第2反应位点的第2数以测定生物学样品中靶核酸的相对量。

2.测定生物学样品中靶核酸的相对量的方法，所述方法包括：

排列自生物学样品获得的多核苷酸以形成多个扩增位点，其中各扩增位点含有平均一个多核苷酸；

扩增多个扩增位点中的多核苷酸以产生扩增产物；

使扩增产物与特异于多个检测位点中的（i）靶核酸、或其部分，及（ii）参照核酸、或其部分的核酸探针杂交，其中各检测位点含有平均一个来自扩增产物的多核苷酸；

测定（i）含有与靶核酸、或其部分杂交的探针的第1检测位点的第1数，及（ii）含有与参照核酸、或其部分杂交的探针的第2检测位点的第2数；以及

比较第1检测位点的第1数与第2检测位点的第2数以测定生物学样品中靶核酸的相对量。

3.权利要求1的方法，其中方法还在杂交步骤之前包括收获扩增产物的步骤。

4.权利要求3的方法，其中杂交步骤用微阵列实施。

5.权利要求1的方法，其中排列步骤通过使用固体，半-固体和/或液体支持物实施。

6.权利要求5的方法，其中排列步骤在固体支持物上实施。

7.权利要求6的方法，其中固体支持物选自：玻璃，光学纤维，氧化硅，微芯片，塑料，珠；生物膜，纤维素。

8.权利要求6的方法，其中排列步骤包括使用流动细胞技术的步骤。

9.权利要求6的方法，其中排列步骤包括在凝胶基质之内分布核酸分子收集物的步骤。

10.权利要求6的方法，其中排列步骤包括使核酸分子收集物与乳剂珠混合的步骤。

11.权利要求5的方法，其中支持物包含多个其上固定的捕获部分以捕获个体多核苷酸。

12.权利要求11的方法，其中捕获部分包含捕获寡核苷酸。

13.权利要求12的方法，其中方法还包括首先处理多核苷酸使得个体多核苷酸在5’和3’端含有适配体序列的步骤，其中适配体序列与固定的捕获寡核苷酸杂交。

14.权利要求1的方法，其中扩增步骤包括实施PCR反应。

15.权利要求14的方法，其中扩增步骤包括实施滚环扩增。

16.权利要求1的方法，其中靶核酸是靶染色体。

17.权利要求16的方法，其中靶染色体选自：第X，Y，13，18或21染色体。

18.权利要求1的方法，其中参照核酸是参照染色体。

19.权利要求18的方法，其中参照染色体是：第1，X，Y，13，18或21染色体。

20.权利要求1的方法，其中靶核酸含有突变。

21.权利要求20的方法，其中突变选自：SNP，缺失，插入，复制和其组合。

22.权利要求1的方法，其中生物学样品包含过丰或亚丰的靶核酸。

23.权利要求22的方法，其中生物学样品包含非整倍体染色体。

24.权利要求2的方法，其中特异于靶核酸、或其部分的核酸探针特异于单个座位。

25.权利要求2的方法，其中特异于靶核酸、或其部分的核酸探针特异于多个座位。

26.权利要求2的方法，其中将特异于靶核酸、或其部分的核酸探针多重化。

27.权利要求26的方法，其中多重化的探针包含2～10,000个探针。

28.权利要求27的方法，其中多重化的特异于靶核酸、或其部分的探针包含500个探针。