[发明专利]核酸计数无效
申请号: | 201180030604.5 | 申请日: | 2011-06-07 |
公开(公告)号: | CN103069005A | 公开(公告)日: | 2013-04-24 |
发明(设计)人: | T·肖勒;B·亨德里克森 | 申请(专利权)人: | 艾索特里克斯遗传实验室有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12M1/34;G01N21/64 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 罗菊华 |
地址: | 美国北*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 核酸 计数 | ||
1.测定生物学样品中靶核酸的相对量的方法,所述方法包括:
排列自生物学样品获得的多核苷酸以形成多个反应位点,其中各反应位点含有平均一个多核苷酸;
扩增多个反应位点中的多核苷酸;
由核酸杂交测定(i)含有靶核酸序列、或其部分的第1反应位点的第1数,及(ii)含有参照核酸序列、或其部分的第2反应位点的第2数;
比较第1反应位点的第1数与第2反应位点的第2数以测定生物学样品中靶核酸的相对量。
2.测定生物学样品中靶核酸的相对量的方法,所述方法包括:
排列自生物学样品获得的多核苷酸以形成多个扩增位点,其中各扩增位点含有平均一个多核苷酸;
扩增多个扩增位点中的多核苷酸以产生扩增产物;
使扩增产物与特异于多个检测位点中的(i)靶核酸、或其部分,及(ii)参照核酸、或其部分的核酸探针杂交,其中各检测位点含有平均一个来自扩增产物的多核苷酸;
测定(i)含有与靶核酸、或其部分杂交的探针的第1检测位点的第1数,及(ii)含有与参照核酸、或其部分杂交的探针的第2检测位点的第2数;以及
比较第1检测位点的第1数与第2检测位点的第2数以测定生物学样品中靶核酸的相对量。
3.权利要求1的方法,其中方法还在杂交步骤之前包括收获扩增产物的步骤。
4.权利要求3的方法,其中杂交步骤用微阵列实施。
5.权利要求1的方法,其中排列步骤通过使用固体,半-固体和/或液体支持物实施。
6.权利要求5的方法,其中排列步骤在固体支持物上实施。
7.权利要求6的方法,其中固体支持物选自:玻璃,光学纤维,氧化硅,微芯片,塑料,珠;生物膜,纤维素。
8.权利要求6的方法,其中排列步骤包括使用流动细胞技术的步骤。
9.权利要求6的方法,其中排列步骤包括在凝胶基质之内分布核酸分子收集物的步骤。
10.权利要求6的方法,其中排列步骤包括使核酸分子收集物与乳剂珠混合的步骤。
11.权利要求5的方法,其中支持物包含多个其上固定的捕获部分以捕获个体多核苷酸。
12.权利要求11的方法,其中捕获部分包含捕获寡核苷酸。
13.权利要求12的方法,其中方法还包括首先处理多核苷酸使得个体多核苷酸在5’和3’端含有适配体序列的步骤,其中适配体序列与固定的捕获寡核苷酸杂交。
14.权利要求1的方法,其中扩增步骤包括实施PCR反应。
15.权利要求14的方法,其中扩增步骤包括实施滚环扩增。
16.权利要求1的方法,其中靶核酸是靶染色体。
17.权利要求16的方法,其中靶染色体选自:第X,Y,13,18或21染色体。
18.权利要求1的方法,其中参照核酸是参照染色体。
19.权利要求18的方法,其中参照染色体是:第1,X,Y,13,18或21染色体。
20.权利要求1的方法,其中靶核酸含有突变。
21.权利要求20的方法,其中突变选自:SNP,缺失,插入,复制和其组合。
22.权利要求1的方法,其中生物学样品包含过丰或亚丰的靶核酸。
23.权利要求22的方法,其中生物学样品包含非整倍体染色体。
24.权利要求2的方法,其中特异于靶核酸、或其部分的核酸探针特异于单个座位。
25.权利要求2的方法,其中特异于靶核酸、或其部分的核酸探针特异于多个座位。
26.权利要求2的方法,其中将特异于靶核酸、或其部分的核酸探针多重化。
27.权利要求26的方法,其中多重化的探针包含2~10,000个探针。
28.权利要求27的方法,其中多重化的特异于靶核酸、或其部分的探针包含500个探针。
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