[发明专利]作为可替代的抗微生物剂的噬菌体裂解酶

说明书

技术领域

本发明涉及用于控制产气荚膜梭状芽孢杆菌(Clostridium perfringens)细菌的噬菌体裂解酶或其功能性片段以及所述裂解酶的用途，包括但不限于治疗由产气荚膜梭状芽孢杆菌所致的疾病的组合物和方法。

背景技术

产气荚膜梭状芽孢杆菌是梭状芽胞杆菌属的革兰氏阳性、杆状、厌氧的产孢细菌。产气荚膜梭状芽孢杆菌在自然界普遍存在，通常可作为腐烂植物、海洋沉积物、人和其他脊椎动物的肠道、昆虫和土壤的成分而发现。尽管普遍存在，并且通常为良性，但产气荚膜梭状芽孢杆菌也是许多动物和人的严重感染的原因。的确，已知产气荚膜梭状芽孢杆菌是食物中毒、气性坏疽(梭菌性肌坏死)、坏死性肠炎、和非食物传播的胃肠感染的原因。因此，产气荚膜梭状芽孢杆菌是人和动物的病原体(Songer, 1997)。尽管所有家畜均可被感染，但产气荚膜梭状芽孢杆菌尤其是养禽业的忧虑。的确，在禽类中，产气荚膜梭状芽孢杆菌导致最具破坏性的损失。

在鸡中，产气荚膜梭状芽孢杆菌导致坏死性肠炎，在现代肉用鸡群中最常见和具经济破坏力的细菌疾病。尽管临床疾病通常非常短暂，但在未经保护的禽群中死亡率可具破坏力。的确，通常在群体中坏死性肠炎的唯一迹象是死亡率的突然增加。除了增加死亡率之外，坏死性肠炎可存在于抑郁、起皱的羽毛和深色腹泻的禽类中。通常，在群体中疾病持续介于约5-10天之间，其具有介于约2-50%之间的死亡率。

通常，通过在水或饲料中预防给药施用的抗微生物药物来控制坏死性肠炎。然而，对在动物饲料中使用抗生素的公众反对声日益增加。例如，在欧洲，已经禁止在动物饲料中使用抗生素(参见例如，van Immerseel等人，2004, 2008)。很快美国也会如此。如果没有用于预防坏死性肠炎和由产气荚膜梭状芽孢杆菌导致的其他疾病的传统抗生素，则这些疾病可能成为养禽业的极大问题。

因此，本领域需要对预防和治疗由产气荚膜梭状芽孢杆菌(特别是影响家禽的产气荚膜梭状芽孢杆菌)所导致疾病有效的传统抗生素的替代选择。

幸运地，如从以下公开明显可见，本发明提供这些和其他需求。

发明内容

在一个实施方案中，本发明提供分离的产气荚膜梭状芽孢杆菌噬菌体裂解酶，其中噬菌体裂解酶是选自CP26F溶素和CP39O溶素的成员，以及其中，噬菌体裂解酶活性导致产气荚膜梭状芽孢杆菌细菌细胞的裂解。在一示例性实施方案中，分离的产气荚膜梭状芽孢杆菌噬菌体裂解酶包含具有与SEQ ID NO:1有至少约90%同一性的氨基酸序列的肽。在另一示例性实施方案中，分离的产气荚膜梭状芽孢杆菌噬菌体裂解酶具有根据SEQ ID NO:1的序列。在另一示例性实施方案中，分离的产气荚膜梭状芽孢杆菌噬菌体裂解酶包含具有与SEQ ID NO:3有至少约90%同一性的氨基酸序列的肽。在又一示例性实施方案中，分离的产气荚膜梭状芽孢杆菌噬菌体裂解酶具有根据SEQ ID NO:3的序列。在又一示例性实施方案中，分离的产气荚膜梭状芽孢杆菌噬菌体裂解酶由产气荚膜梭状芽孢杆菌噬菌体分离，该产气荚膜梭状芽孢杆菌噬菌体是选自具有ATCC保藏名称PTA-11081的产气荚膜梭状芽孢杆菌噬菌体CP39O以及具有ATCC保藏名称PTA-11080的产气荚膜梭状芽孢杆菌噬菌体CP26F的成员。

在另一实施方案中，本发明提供编码产气荚膜梭状芽孢杆菌噬菌体裂解酶的分离的核酸分子，其中噬菌体裂解酶是选自CP26F溶素和CP39O溶素的成员，以及其中，噬菌体裂解酶活性导致产气荚膜梭状芽孢杆菌细菌细胞的裂解。在一示例性实施方案中，分离的核酸分子是选自编码具有与SEQ ID NO:1有至少约90%同一性的氨基酸序列的肽的分离的核酸以及编码具有与SEQ ID NO:3有至少约90%同一性的氨基酸序列的肽的分离的核酸的成员。在另一示例性实施方案中，分离的核酸分子编码具有根据SEQ ID NO:1的氨基酸序列的肽。在另一示例性实施方案中，分离的核酸分子编码具有根据SEQ ID NO:3的氨基酸序列的肽。