[发明专利]变异型DNA的检测方法有效
申请号: | 201180045949.8 | 申请日: | 2011-09-22 |
公开(公告)号: | CN103298951A | 公开(公告)日: | 2013-09-11 |
发明(设计)人: | 松隈章一;石川友一 | 申请(专利权)人: | 和光纯药工业株式会社;地方独立行政法人神奈川县立医院机构 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/09;G01N27/447;G01N33/53 |
代理公司: | 北京律诚同业知识产权代理有限公司 11006 | 代理人: | 高龙鑫 |
地址: | 日本大阪*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 异型 dna 检测 方法 | ||
1.一种变异型DNA的检测方法,其是使用了探针的变异型DNA的检测方法,其特征在于:
(1)使含有具有取代碱基、缺失碱基区域或插入碱基区域的单链DNA即变异型DNA或/和其对应的野生型的单链DNA即野生型DNA的试样和与两单链DNA杂交的探针接触,形成与变异型DNA的杂交体即变异型杂交体或/和与野生型DNA的杂交体即野生型杂交体,得到的变异型杂交体及野生型杂交体中的至少一方具有茎结构;
(2)利用茎结构的有无或茎结构的差异,通过电泳法将得到的变异型杂交体或/和野生型杂交体分离;
(3)检测试样中有无变异型DNA。
2.根据权利要求1所述的检测方法,其中,变异型DNA是具有取代碱基的单链DNA。
3.根据权利要求2所述的检测方法,其中,变异型杂交体及野生型杂交体中的至少一方在探针侧具有茎结构。
4.根据权利要求3所述的检测方法,其中,变异型杂交体及野生型杂交体进一步在基因组DNA侧具有环结构或茎结构。
5.根据权利要求3所述的检测方法,其中,探针是由以下的任一序列表示的探针,
3’ 1stSSl一X’1-STP1-X'2-X’3-X’4-X’5-2ndSSl 5’
或者
3’ 1stSSl-X’1-X'2-X’3-X’4-StP1-X'5-2ndSS1 5
所述序列中,1stSS1、2ndSS1分别表示与野生型DNA及变异型DNA互补的单链的碱基序列,X’1及X’5表示任意的碱基,X’2~X’4表示任意的碱基或结合键,其中的任意一个是与变异碱基互补的碱基或与变异碱基所对应的正常碱基互补的碱基,该与变异碱基互补的碱基或与正常碱基互补的碱基在杂交时存在于变异型DNA的取代碱基及野生型DNA的正常碱基所对应的位置上,StP1表示在探针侧形成茎结构的序列。
6.根据权利要求2所述的检测方法,其中,变异型杂交体及野生型杂交体中的至少一方在基因组DNA侧具有茎结构。
7.根据权利要求6所述的检测方法,其中,变异型杂交体及野生型杂交体进一步在探针侧具有环结构或茎结构。
8.根据权利要求6所述的检测方法,其中,探针是由以下的序列表示的探针,
3’ 1stSS31-X'31-X’32-X'33-2ndSS31 5’
序列中,1stSS31、2ndSS31分别表示与野生型DNA及变异型DNA互补的单链的碱基序列,X’31、X’32及X’33分别表示任意的碱基,X’32表示与取代碱基互补的碱基或与正常碱基互补的碱基。
9.根据权利要求1所述的检测方法,其中,变异型DNA是具有缺失碱基区域的单链DNA。
10.根据权利要求9所述的检测方法,其中,变异型杂交体及野生型杂交体中的至少一方在探针侧具有茎结构。
11.根据权利要求10所述的检测方法,其中,变异型杂交体及野生型杂交体进一步在基因组DNA侧具有环结构或茎结构。
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