[发明专利]高通量鉴别对抗病原体的微生物拮抗剂的方法在审

专利信息
申请号: 201180050598.X 申请日: 2011-10-25
公开(公告)号: CN103180453A 公开(公告)日: 2013-06-26
发明(设计)人: J·S·科瑞卫;R·T·麦卡恩盖尔 申请(专利权)人: 合成基因组股份有限公司
主分类号: C12Q1/18 分类号: C12Q1/18
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 赵蓉民;张全信
地址: 美国加利*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 通量 鉴别 对抗 病原体 微生物 拮抗剂 方法
【权利要求书】:

1.一种用于选择具有对抗病原体的拮抗活性的微生物的方法,所述方法包括:

a)提供多重测试平台和多个微生物样品,其中所述多重测试平台包括一个或多个含有所述病原体的分散群体的固体微生物生长培养基;

b)分别和同时使所述微生物样品各自与所述分散的病原体群体接触;

c)共培养所述微生物样品与所述分散的病原体群体以评估所述病原体对每个所述微生物样品的反应;和

d)选择一个或多个包含具有对抗所述病原体的拮抗活性的所述微生物的微生物样品。

2.根据权利要求1所述的方法,其中所述多个微生物样品包括至少12、24、48、96、200、384、400、500、1000或1500个微生物样品。

3.根据权利要求1所述的方法,其中一个或多个所述微生物样品是分离的微生物培养物。

4.根据权利要求1所述的方法,其中至少一个所述微生物样品包含两种或更多种分离的微生物的混合物。

5.根据权利要求1所述的方法,其中一个或多个所述微生物样品是直接从自然环境获得。

6.根据权利要求1所述的方法,其中所述病原体是植物病原体。

7.根据权利要求6所述的方法,其中所述植物病原体是真菌。

8.根据权利要求6所述的方法,其中所述植物病原体选自由以下组成的组:炭疽菌属、镰刀菌属、赤霉菌属、明梭孢属和壳多孢属。

9.根据权利要求1所述的方法,其中所述分散的病原体群体包括在所述固体微生物生长培养基的表面上形成细胞层的所述病原体的细胞。

10.根据权利要求1所述的方法,其中所述分散的病原体群体包括在所述固体微生物生长培养基固化前与所述培养基混合并由此并入到所述培养基中的所述病原体的细胞。

11.根据权利要求1所述的方法,其中所述多重测试平台包括包含一个或多个单独隔室的多隔室装置,并且其中每个隔室能够充当固体微生物生长培养基的容器。

12.根据权利要求11所述的方法,其中所述多重测试平台的所述隔室中的至少一个与其它隔室的不同之处在于包含不同病原体的分散群体。

13.根据权利要求11所述的方法,其中共培养每个所述微生物样品与所述分散的病原体群体是在所述多重测试平台的单独隔室中进行的。

14.根据权利要求1所述的方法,其中所述多重测试平台是选自由以下组成的组的形式:微板、微量滴定板、多孔板、陪替氏培养皿、托盘、载玻片和试管。

15.根据权利要求1所述的方法,其中评估所述病原体对每个所述微生物样品的反应包括确定生长抑制区的存在、生长抑制区的直径、化学化合物的产生、所述病原体的形态学和/或生理学的变化,或其任何组合。

16.根据权利要求1所述的方法,所述方法进一步包括在使所述微生物样品与所述分散的病原体群体接触之前或同时,将每个所述微生物样品分选成单细胞或细胞亚群的步骤。

17.根据权利要求16所述的方法,其中所述分选步骤包括使用流式细胞仪细胞分选技术。

18.根据权利要求1所述的方法,所述方法进一步包括确定所述微生物的分类学分类的步骤。

19.一种通过根据权利要求1所述的方法选择的分离的微生物,其中所述微生物具有对抗病原体的拮抗活性。

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