[发明专利]抗菌噬菌体、噬菌体肽及其使用方法

说明书

1.序列表

本申请含有经由EFS-Web以ASCII形式提交并且在此通过引用整体合并的序列表。所述ASCII拷贝于2011年9月14日创建，命名为16395US1.txt且大小为3,295,858字节。

2.相关申请

本申请要求于2010年9月17日提交的美国临时申请号61/384,015的优先权，所述美国临时申请的内容在此通过引用整体合并。

3.发明领域

本发明涉及用于治疗和控制细菌感染的噬菌体疗法领域。特别地，本发明涉及新型噬菌体F387/08、F391/08、F394/08、F488/08、F510/08、F44/10、F125/10，其分离的多肽，包含一种或多种新型细菌噬菌体和/或分离的多肽的组合物；和单独或与其他疗法例如抗生素或其他噬菌体疗法组合用于治疗和预防通过下述引起的细菌感染的方法：例如金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)、鲍氏不动杆菌(Acinetobacter baumannii)、大肠杆菌(Escherichia coli)和/或铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)。

4.背景

细菌噬菌体(噬菌体)是特异性感染且裂解细菌的病毒。噬菌体疗法，使用完整噬菌体病毒用于治疗细菌性传染病的方法，在20世纪20年代通过Felix d’Herelle引入。最初，噬菌体疗法得到强烈调查，并且进行众多研究以评估噬菌体疗法用于治疗人和动物中的细菌感染的潜力。早期成功促使多种商业噬菌体制剂的开发。例如，在1940年，Eli Lilly Company生产了用于人使用的7种噬菌体产品，包括用于治疗由葡萄球菌属物种(Staphylococcus sp.)、大肠杆菌及其他致病菌引起的不同疾病的噬菌体制剂。这些制剂例如用于治疗引起脓肿的感染、化脓性伤口、阴道炎、急性慢性上呼吸道感染和乳突炎感染。

然而，随着抗生素在20世纪40年代的开发，对基于噬菌体的治疗的兴趣在西方世界下降。促成这种下降的最重要因素之一是缺乏标准化测试方案和生产方法。开发用于测试噬菌体疗法的工业广泛标准的失败干扰研究结果的文件证明，导致察觉到的功效缺乏以及关于噬菌体疗法价值的可靠性问题。进一步地，与噬菌体样品/样本生产相关的问题使最初研究和调查复杂化。多种稳定剂和防腐剂最初在增加噬菌体治疗的活性的尝试中使用。然而，因为噬菌体和多种稳定剂的生物学知之甚少，所以在延长噬菌体制剂活力的尝试中加入的许多成分证明对于人是毒性或负面影响长期贮存。在噬菌体生产中的另一个问题涉及噬菌体的商业制剂的纯度级别。当时，噬菌体疗法制剂一般由宿主细菌的原始裂解产物组成，所述宿主细菌已用目的噬菌体处理。因此，许多制剂含有目前公认为不需要的细菌组分例如内毒素的那种。相应地，不利事件通常与制剂相关，特别是在静脉内接受其的患者中。然而，在对于抗生素的接近受限的东部欧洲和前苏联，噬菌体疗法的开发和使用与抗生素共同继续或代替抗生素继续。

然而，随着许多细菌的抗生素抗性菌株的出现，在基于噬菌体的治疗中的兴趣在西方世界已回复。尽管已开发了新型种类的抗生素，但细菌最终将发展对于新药物的抗性的前景已加剧对用于控制、预防和治疗细菌感染的非化学治疗方法的寻找。存在关于在临床环境中使用噬菌体疗法的三个主要的基于噬菌体的策略：1)施用毒性噬菌体；2)使用由细菌噬菌体编码的内溶素或纯化的溶素，3)使用噬菌体的结构蛋白质作为关键细菌酶例如合成肽聚糖的酶的代谢抑制剂。

因此，需要开发新型细菌噬菌体和噬菌体产物作为用于在体内针对致病菌使用的潜在治疗和/或预防试剂。特别地，需要能够裂解医院细菌的细菌噬菌体，所述医院细菌包括金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯氏菌、鲍氏不动杆菌、大肠杆菌和/或铜绿假单胞菌。因为迄今为止研究的大多数噬菌体和噬菌体肽显示出特异性针对它们由其分离的细菌物种(或亚种)的活性，所以新型基于噬菌体的疗法可以在医院背景中特别有用，选择性靶向医院病原体而不影响正常周围菌丛。

5.发明概述