[发明专利]用于植物的SSR标志物及其用途无效
申请号: | 201180072883.1 | 申请日: | 2011-09-30 |
公开(公告)号: | CN103764842A | 公开(公告)日: | 2014-04-30 |
发明(设计)人: | 谢钻珠;杨淑华;李荣华;叶孙裕;傅映鸣;李盈桦 | 申请(专利权)人: | ACGT知识有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 韩威威 |
地址: | 英属维尔京*** | 国省代码: | 维尔京群岛;VG |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 植物 ssr 标志 及其 用途 | ||
1.测定植物样品的基因型的方法,包括:
(i)提供来自所述样品的DNA;
(ii)用选自下列的至少一个引物对扩增至少一种多态SSR标志物:SEQ ID NO:1和2;SEQ ID NO:3和4;SEQ ID NO:5和6;SEQ ID NO:7和8;SEQ ID NO:9和10;SEQ ID NO:11和12;SEQ ID NO:13和14;SEQ ID NO:15和16;SEQ ID NO:17和18以及SEQ ID NO:19和20,或者各对的片段或变体;及
(iii)鉴定所述样品中的至少一种多态等位基因。
2.权利要求1的方法,其中步骤(ii)包括用对应引物对扩增2种或更多SSR标志物。
3.权利要求1或2的方法,
其中步骤(ii)包括用对应引物对扩增10种SSR标志物中的每一种;及步骤(iii)包括自样品中的10种SSR标志物中的每一种鉴定至少一种多态等位基因。
4.前述权利要求之任一项的方法,其中步骤(iii)包括分离扩增产物以鉴定多态等位基因或测序以鉴定多态等位基因。
5.前述权利要求之任一项的方法,其用于鉴定等位基因多态性。
6.前述权利要求之任一项的方法,其用于鉴定种群中的相同或相关的植物基因型。
7.前述权利要求之任一项的方法,其用于区分种群中的植物变体。
8.前述权利要求之任一项的方法,其用于研究种群中的遗传多样性。
9.前述权利要求之任一项的方法,其中所述植物包括产油植物。
10.前述权利要求之任一项的方法,其中所述植物包括麻风树属(Jatropha)、油棕或大豆。
11.前述权利要求之任一项的方法,其中所述植物包括麻风树(Jatropha curcas)。
12.区别麻风树(Jatropha curcas)的方法,包括以下步骤:
(i)提供来自植物样品的DNA;
(ii)用选自下列的至少一个引物对扩增至少一种多态SSR标志物:SEQ ID NO:1和2;SEQ ID NO:3和4;SEQ ID NO:5和6;SEQ ID NO:7和8;SEQ ID NO:9和10;SEQ ID NO:11和12;SEQ ID NO:13和14;SEQ ID NO:15和16;SEQ ID NO:17和18以及SEQ ID NO:19和20,或者各对的片段或变体;及
(iii)鉴定所述样品中的至少一种对应于麻风树(J.curcas)等位基因的多态等位基因。
13.用于扩增至少一种SSR标志物的分离的寡核苷酸引物,其包含选自下列的序列:SEQ ID NO:1~20或其片段或变体。
14.用于扩增至少一种SSR标志物的分离的寡核苷酸引物对,其选自:SEQ ID NO:1和2、SEQ ID NO:3和4、SEQ ID NO:5和6、SEQ ID NO:7和8、SEQ ID NO:9和10、SEQ ID NO:11和12、SEQ ID NO:13和14、SEQ ID NO:15和16、SEQ ID NO:17和18以及SEQ ID NO:19和20,或者各对的片段或变体。
15.分离的SSR标志物,其由权利要求13的引物对扩增。
16.分离的SSR标志物,其包含选自下列的序列:SEQ ID NO:21~30或其片段或变体。
17.权利要求16的分离的SSR标志物,其中所述变体包含多态变体。
18.权利要求17的分离的SSR标志物,其中所述多态变体包含重复SSR基序(TA)n或(TAA)n。
19.试剂盒,其包含至少一个权利要求13的分离的寡核苷酸引物。
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