[发明专利]耐盐碱绒毛白蜡SCAR标记及其在辅助选择育种中的应用

说明书

技术领域

本发明涉及一种SCAR标记及其应用，尤其涉及一种耐盐碱绒毛白蜡SCAR标记及其在辅助选择育种中的应用，属于生物技术领域。

背景技术

白蜡属全世界约70余种，大多数分布在北半球暖温带，中国已有34种，其中原产26种，国外引进8种。绒毛白蜡(Fraxinus VelutinaTorr.)为木犀科(Oleaceae)白蜡属(Fraxinus Linn.)落叶乔木，原产为美国，生长快，树干通直，木质结构均匀，纹理美观，易繁殖、抗逆，是优良盐碱地造林、园林绿化和珍贵的用材树种。早在1911年引种到济南(孟昭和等，2001)，1953年被转引到天津(杨瑞兴等，1996)，80年代后在华北华东地区广泛栽培。目前已成为我国华北、华东主要沿海城市及盐碱地区造林和园林绿化优良树种(时明芝，1996；王勤等，2000；倪国祥等，1995；王友平等，2007)。

国内关于白蜡生态特性、生长习性方面的研究较多，主要侧重于白蜡的耐盐碱性、苗木繁育、造林技术等方面。樊宝敏(1992)报道，绒毛白蜡对呈碱性反应的滨海盐土较为敏感；孟康敏(1999)对5个滨海盐碱地引种的树种幼苗进行盆栽耐盐性试验，根据光合速率、叶绿素含量、细胞膜透性、丙二醛含量、游离脯氨酸含量等5个耐盐性生理指标进行综合评判，结果表明绒毛白蜡耐盐力最强；刘德玺等(2008)以盐渍生境下1-3年生红梣为材料，对不同树龄红梣的各营养器官中盐离子分布规律进行了研究；王友平等(2009)研究了盐渍生境下1-3年生绒毛白蜡不同营养器官中盐离子分布规律。近年来国外报导多集中在欧洲白蜡(F.excelsior)的核DNA微卫星、叶绿体微卫星标记、EST-SST标记筛选分离，以及微卫星标记在种群遗传分析与系统发生生物地理学研究上。Heurtz等(2004)通过对全欧洲野生F.excelsior群体的叶绿体DNA与叶绿体微卫星分析认为，较低的单倍体多态是由于风媒植物的基因流影响。Bacles等(2008)利用微卫星标记进行了大尺度景观下苏格兰F.excelsior群体的花粉基因流的父本分析，花粉基因流的交换取决于群体大小，而不是地理位置。Goto等(2006)利用5个微卫星位点对日本北部滨海森林的F.mandshurica var.japonica的亲本与后代的基因型分析，结果表明小范围内亲本的个体分析可以为风媒植物提供定量的分析。对绒毛白蜡(F.Velutina)的相关DNA标记序列未能在GenBank上检索到，遗传学基础研究十分薄弱，遗传背景信息匮乏，这在很大程度上限制了选择育种工作的顺利开展。因此开展相应的遗传学基础研究、定位重要经济性状是我国白蜡选育工作中首先需要解决的问题。此外，传统的白蜡分类主要依靠果实形状和果翅数目的不同，该分类方法无法有效的在幼树早期进行应用。因此利用分子生物学办法、建立有效、快捷的种质鉴别方法对解决我国白蜡树良种选育具有重要的意义。

分子标记辅助选择育种是一种新型的育种方式，应用分子标记辅助选择育种，可有效的检测基因型，进行QTL定位，直接通过标记基因辅助选择含有目标基因型的个体。与传统的育种方法相比，分子标记辅助选择育种方法，直接以DNA形式出现，在植物体的各个组织、各发育时期均可检测到，不受季节、环境的限制，不存在表达与否的问题；数量多，遍及整个基因组；多态性高，利用大量引物、探针可完成覆盖基因组的分析；中性标记，即不影响目标性状的表达，与不良性状无必然的连锁共显性标记，能够鉴别出纯合的基因型与杂合的基因型，提供完整的遗传信息。RFLP标记、AFLP标记操作较为繁琐，而RAPD标记准确性和稳定性较差，均不适合于大规模的田间材料的鉴定工作；SCAR标记操作简便、准确性高、稳定性高克服了上述标记的缺点，为首选的分子标记方法。由于林木育种周期长，要改变在绒毛白蜡育种领域上的落后局面，关键在于尽快广泛收集品种资源，走现代分子生物学技术与常规育种相结合的道路，缩短育种年限，加快分子标记辅助选择利用的研究。因此，获得耐盐碱绒毛白蜡SCAR标记，对于绒毛白蜡良种选育具有重要的意义，为我国耐盐碱林木种质的选育研究提供理论基础和技术体系；丰富耐盐碱绿化树种的遗传多样性，扼制土地盐渍化，提高土地生产力；增加生态、社会和经济效益都具有现实而深远的意义。

发明内容

本发明的目的是提供一种耐盐碱绒毛白蜡SCAR标记及其在用于辅助选择育种中的应用。

本发明所述的耐盐碱绒毛白蜡SCAR标记，其特征在于，该SCAR标记是全长592bp的特异片段S20-592，其核酸序列如SEQ ID NO.1所示。