[发明专利]一个核酸适配子筛选文库无效
申请号: | 201210045270.5 | 申请日: | 2012-02-27 |
公开(公告)号: | CN102732972A | 公开(公告)日: | 2012-10-17 |
发明(设计)人: | 张焜和;张慧卿;张贝;谭新颖;方念;邬芳玉;吕农华;张吉翔 | 申请(专利权)人: | 南昌大学 |
主分类号: | C40B40/06 | 分类号: | C40B40/06;C12N15/115;C12N15/10;C12Q1/68 |
代理公司: | 南昌新天下专利商标代理有限公司 36115 | 代理人: | 施秀瑾 |
地址: | 330031 江西省*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一个 核酸 配子 筛选 文库 | ||
1.一个核酸适配子筛选文库,其特征在于文库及其PCR扩增引物具有特定的核苷酸序列:
文库序列:5′-ACC GAC CGT GCT GGA CTC T(N40)ACT ATG AGC GAG CCT GGC G-3′
上游引物序列:5′-ACC GAC CGT GCT GGA CTC T-3′
下游引物序列:5′-CGC CAG GCT CGC TCA TAG T-3′。
2.根据权利要求1所述的核酸适配子筛选文库,其特征在于:通过人工合成或其他生物学技术,制备5′ 端含19个特定核苷酸组成的固定序列ACC GAC CGT GCT GGA CTC T、中间含40个核苷酸组成的随机序列、3′ 端含19个特定核苷酸组成的固定序列ACT ATG AGC GAG CCT GGC G的随机单链寡核苷酸文库,用于任何靶标的核酸适配子的筛选。
3.根据权利要求1所述的核酸适配子筛选文库,其特征在于:通过人工合成或其他生物学技术,制备序列为5′-ACC GAC CGT GCT GGA CTC T-3′和5′-CGC CAG GCT CGC TCA TAG T-3′的引物对,使用PCR技术或其他生物技术扩增文库序列,应用于核酸适配子的筛选以及适配子的检测、分析及应用。
4.根据权利要求1所述的核酸适配子筛选文库,其特征在于:对文库两端的固定序列的个别核苷酸进行替换、颠倒、移位,或对其长度进行小幅延长或缩短,或对文库中间的随机序列进行延长或缩短,或对扩增文库的引物作相应的简单改造,然后制备简单改造后的文库和引物进行适配子筛选、PCR扩增和适配子分析与应用。
5.根据权利要求1所述的核酸适配子筛选文库,其特征在于:随机改变文库中间的随机序列区,通过计算机软件模拟寡核苷酸序列的二级结构或三级结构,设计出适配子或改造从本文库筛选出的适配子。
6.根据权利要求1、2、3、4或5所述的核酸适配子筛选文库,其特征在所述的核酸适配子筛选文库为ssDNA文库或RNA文库。
7.利用权利要求1~5项中所述的任何一项进行适配子的筛选、分析、改造和应用。
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