[发明专利]AP3D1基因作为猪初生重性状相关的分子标记

说明书

技术领域

本发明属于猪的分子标记辅助选择技术领域，具体涉及一种作为猪标记辅助选择的与初生重性状相关的分子标记的克隆及应用。本发明的分子标记与AP3D1基因有关。

背景技术

近年来，人们对猪肉的消费量与日俱增，如何提高生产性能、降低生产成本成了猪育种工作者的工作重点之一。猪的初生重作为一个重要的繁殖性状，与猪出生后的生长速度及育成率有着不可分割的密切联系。猪场经济效益与初生重有非常强的正相关关系，也是猪场经济效益的第一限制性因素。最近有很多文献报道了初生重对生长速度的影响，李剑豪(李剑豪.长白猪初生重对生长速度及哺育率的影响.仔猪生产[J].2006.18)研究发现长白猪60日龄重与35日龄重均与初生重呈正相关且初生重与生长速度呈正相关。Beaulieu等(Beaulieu AD，Aalhus JL，Williams NH，Patience JF.Impact of piglet birth weight，birth order and litter size on subsequent growth performance，carcass quality，muscle composition and eating quality of pork[J].J Anim Sci.2010)研究发现，初生重较低的猪生长速度较慢，从而使其进入市场的时间增加。另有研究表明仔猪的初生重与育成率亦悉悉相关，初生重在1.0Kg以下时仔猪育成率随着初生重的增加而上升；初生重在1.0Kg以上时仔猪育成率没有明显的规律。初生重小于等于0.5Kg时仔猪育成率仅为55.56％(高建国.二花脸猪初生重对生长速度及育成率的影响[J].畜牧与兽医，1992，24(1)：26)。大量调查数据证明，仔猪初生重1.5～1.6千克的猪场经济效益要比初生重1.2～1.3千克的猪场好得多。此外，科学家发现体重越轻的新生儿，其长大后患II型糖尿病、心血管疾病和高血压的风险越大，有研究证明这一现象与基因的变异有关(Freathy等，Variants in ADCY5 and near CCNL1 are associated with fetal growth and birth weight[J].Nat Genet，2010，42(5)：430-435)。

因此，对猪初生重相关基因的克隆和鉴定可为解释猪和其它哺乳动物胎儿生长发育的遗传机制提供重要线索，并为猪的繁殖性状遗传改良提供理论依据。寻找基因中的多态位点，通过与性状间的关联分析发现基因与性状间的关系是研究基因功能的一个重要手段，也是进行标记辅助选择的基础。AP3D1基因编码接头蛋白复合体AP3的一个亚基，该复合体参与细胞质内蛋白分选、转运小泡的形成以及溶酶体膜糖蛋白的转运(Le Borgne R，Alconada A，Bauer U，Hoflack B.The mammal ian AP-3 adaptor-like complex mediates the intracellular transport of lysosomal membrane glycoproteins[J].J Biol Chem.1998，273(45)：29451-29461)。此外，AP3D1亚基与色素颗粒在细胞内的发生与运输有关，并有可能与血小板致密颗粒及神经递质的发生和运输有关(Danglot L，Galli T.What is the function of neuronal AP-3？[J].Biol Cell.2007，99(7)：349-361)。以上研究证明，AP3D1基因参与多种生物学过程，可能与母体与胎儿间营养物质的转运和利用有关，因此，本研究拟探讨AP3D1基因与猪初生重的关系，寻求获得一种与猪初生重性状相关的分子标记。

发明内容

本发明的目的在于从AP3D1基因中克隆一种作为猪标记辅助选择的与初生重性状相关的分子标记，揭示其在猪标记特别是猪初生重性状关联分析中的应用。

本发明通过以下技术方案实现：

申请人从报道猪基因AP3D1克隆得到与猪初生重性状相关基因的部分DNA片段，它的DNA序列如序列表SEQ ID NO：1和图2所述。在序列表SEQ ID NO：1的第234bp处有一个A234-G234的碱基突变，导致BsrBI-RFLP多态性。这个碱基突变位于AP3D1基因第17内含子中。

本发明所述的分子标记的制备方法是：