[发明专利]采用复合EST-SSR标记进行大白菜品种鉴定的方法无效
申请号: | 201210068375.2 | 申请日: | 2012-03-15 |
公开(公告)号: | CN102586459A | 公开(公告)日: | 2012-07-18 |
发明(设计)人: | 赵新;王永;兰青阔;陈锐;朱珠;郭永泽;程奕 | 申请(专利权)人: | 天津市农业科学院中心实验室 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 天津市杰盈专利代理有限公司 12207 | 代理人: | 朱红星 |
地址: | 300381 天津*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 采用 复合 est ssr 标记 进行 大白菜 品种 鉴定 方法 | ||
1.用于大白菜品种鉴定的EST-SSR引物, 其特征在于,包括Ⅰ套或Ⅱ套EST-SSR复合引物,其中的Ⅰ套EST-SSR复合引物包括:
BC1上游引物序列:5’- TTTGTCCCTATTGCTCAGGG -3’,BC1下游引物序列: 5’- CCGAGAACGTCTTCTCCTTG -3’;BC19上游引物序列:5’- TTGAAACTTGGTTGACGACG -3’,BC19下游引物序列: 5’- TTCTTCTTTGCGGCTGATTT -3’;BC26上游引物序列:5’- ATAACAACAACCTGCCCGAG -3’,BC26下游引物序列: 5’- GAAGCACAAGAACAGGGCTC -3’;
Ⅱ套EST-SSR复合引物,包括BC1上游引物序列:5’- TTTGTCCCTATTGCTCAGGG -3’,BC1下游引物序列: 5’- CCGAGAACGTCTTCTCCTTG -3’;BC9上游引物序列:5’- ACCTTCCGTCTCTGGGTCTT -3’,BC9下游引物序列: 5’- TTTTGAACGAGGTGGAGGAC -3’;BC10上游引物序列:5’- GAATCCTTTGGAAACGACGA -3’,BC10下游引物序列: 5’- GGGGACACAATTCTCCTGAA -3’;BC16上游引物序列:5’- CTTGCAAATGACCTGCTTGA -3’,BC16下游引物序列: 5’- GGGAGTTGGAGATGAGGTGA -3’;BC27上游引物序列:5’- ATCCAAAAGGAAGAATCCCG -3’,BC27下游引物序列: 5’- AAACGAGAATTTTCCTGCGA -3’ 。
2.一种采用复合EST-SSR标记进行大白菜品种鉴定的方法,其特征在于按如下步骤的步骤进行:
(1)采用权利要求1所述的复合EST-SSR引物对供试品种样品模板DNA进行PCR扩增,其中的PCR扩增反应的总体积为10 μL,扩增反应体系为:2×GoTaq? Master Mixes 5 μL,上游和下游引物10μmol/L各0.25μL,供试品种大白菜杂交种基因组DNA模板,浓度50 ng/μL,1μL,双蒸水补足10 μL;PCR反应程序为94℃预变性5 min,35个扩增循环(94℃ 1 min,53.5℃ 45 sec,72℃ 45 sec);72℃延伸7 min,4℃保存;
(2)对PCR扩增产物进行凝胶电泳,非变性聚丙烯酰胺凝胶浓度为8%,凝胶组分为:去离子水21mL,10×TBE 3 mL,40% PAG 6 mL,TMED 30 μL,10% 过流酰胺 300 μL;设定电压 250 V,电泳 1 h,关闭电源,进行染色;染色过程:银染8~10 min,迅速水洗,NaOH显色数分钟,直至条带清晰即可,再次水洗;
(3)通过分析EST-SSR结果,比较12份大白菜品种间多态性位点的差异,确定2套复合引物的多态率及多态信息量;在相同迁移率位置上进行“1,0”标注,构建12份大白菜品种的SSR分析谱带数据,通过数据分析复合引物是否可对12份大白菜品种进行完全的区分,同时构建12份大白菜品种的指纹图谱;
其中所述的上游和下游引物10μmol/L各0.25μL,指的是Ⅰ套EST-SSR复合引物中BC1上游引物0.25μL、BC1下游引物0.25μL,BC19上游引物0.25μL、BC19下游引物0.25μL,BC26上游引物0.25μL、BC26下游引物0.25μL,或Ⅱ套EST-SSR复合引物中BC1上游引物0.25μL、BC1下游引物0.25μL,BC9上游引物0.25μL、BC9下游引物0.25μL,BC10上游引物0.25μL、BC10下游引物0.25μL,BC16上游引物0.25μL、BC16下游引物0.25μL,BC27上游引物0.25μL、BC27下游引物0.25μL。
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