[发明专利]磷硫酰化DNA的酶促合成方法有效
申请号: | 201210091733.1 | 申请日: | 2012-03-31 |
公开(公告)号: | CN102899316A | 公开(公告)日: | 2013-01-30 |
发明(设计)人: | 由德林;曹博;邓子新;郑晓青 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12R1/42 |
代理公司: | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人: | 郭国中 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 磷硫酰化 dna 合成 方法 | ||
1.一种磷硫酰化DNA的酶促合成方法,其特征在于,包括如下步骤:以DNA和L-半胱氨酸为底物,加入DNA磷硫酰化修饰酶蛋白或者含有DNA磷硫酰化修饰酶蛋白的全细胞裂解液,在合适条件下发生磷硫酰化修饰酶促反应,获得磷硫酰化修饰的DNA。
2.根据权利要求1所述的磷硫酰化DNA的酶促合成方法,其特征在于,所述全细胞裂解液的制备包括如下步骤:接种沙门氏菌(Salmonella enterica)serovar Cerro 87至LB培养基中,培养,收集菌体,用磷酸缓冲液洗涤所述菌体,用反应缓冲液重悬,冻融,超声破碎所述菌体,离心,取上清液,即获所述全细胞裂解液。
3.根据权利要求2所述的磷硫酰化DNA的酶促合成方法,其特征在于,所述反应缓冲液包括20mM Tris-HCl、60mM KCl、10mM MgCl2、1mM EDTA、2mM DTT、1mM PMSF和体积比为25%的甘油,所述反应缓冲液的pH为8.0。
4.根据权利要求2所述的磷硫酰化DNA的酶促合成方法,其特征在于,所述酶促反应包括如下步骤:制备短链DNA-链霉亲和素复合体,向所述DNA-链霉亲和素复合体中加入所述全细胞裂解液,再加入终浓度为1mM的ATP、0.1mM的PLP和0.1mM的Cys,常规条件下反应,离心终止反应,用磷酸缓冲液洗涤反应物。
5.根据权利要求1所述的磷硫酰化DNA的酶促合成方法,其特征在于,所述DNA磷硫酰化修饰酶蛋白的制备包括如下步骤:从沙门氏菌克隆DNA磷硫酰化修饰的酶蛋白基因,构建质粒表达载体,转化宿主细胞,诱导表达,裂解,镍柱亲和纯化,FPLC纯化,蛋白浓缩,即得所述DNA磷硫酰化修饰酶蛋白。
6.根据权利要求5所述的磷硫酰化DNA的酶促合成方法,其特征在于,所述沙门氏菌为沙门氏菌(Salmonella enterica)serovar Cerro 87。
7.根据权利要求5所述的磷硫酰化DNA的酶促合成方法,其特征在于,所述酶促反应包括如下步骤:取基因组DNA和所述DNA磷硫酰化修饰酶蛋白置于反应缓冲液,并加入终浓度为1mM的ATP、0.1mM的PLP和0.1mM的Cys,30℃下进行反应,加入苯酚氯仿抽提,抽提后的上清加入异丙醇沉淀,洗涤,干燥,即获磷硫酰化修饰的DNA。
8.根据权利要求7所述的磷硫酰化DNA的酶促合成方法,其特征在于,所述反应缓冲液包括20mM的Tris-HCl和10mM的MgCl2,所述反应缓冲液的pH为8.0。
9.根据权利要求7所述的磷硫酰化DNA的酶促合成方法,其特征在于,所述各酶蛋白的重量份相同。
10.根据权利要求1所述的磷硫酰化DNA的酶促合成方法,其特征在于,所述DNA的链长为30bp或4Mbp。
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