[发明专利]识别含对硝基苯磺酰胺基的化合物的核酸适体及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及一种识别含对硝基苯磺酰胺基的化合物的核酸适体及其应用。

背景技术

配体指数富集系统进化(Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment，SELEX)技术是一种在体外从组合核酸文库中筛选出特异识别某一个或一类靶标的核酸分子(核酸适体)的新的组合化学技术。目前，SELEX技术在基础研究、生物筛选等方面得到了很好的应用，并且在临床诊断方面也有广阔的应用前景。

核酸适体(aptamer)是一类能特异紧密结合相应靶分子的单链核酸序列，通常由15到150个核苷酸组成，包括DNA、RNA、肽核酸或化学修饰的核酸。核酸适体通过范德华力、氢键或静电作用与靶分子高亲和力，高特异性地相互结合作用。它的高亲和力和特异性可以与抗体相媲美，因此它又称为核酸或者化学的“抗体”。迄今为止，已筛选出了数百个核酸适体，它们的靶物质范围很广，包括无机金属离子、有机小分子、生物大分子、以及病毒、细菌、细胞和组织切片等。

与单克隆抗体相比，核酸适体具有以下优点：(1)在体外筛选，无需免疫动物或细胞。因此其靶目标范围更广，可以是无机金属离子、激素、毒素，还可以是细胞，从理论上上讲任何靶标都可以筛选得到其核酸适体；(2)低毒性或免疫源性，且具有很好的水溶性，可以直接进行大剂量的皮下静脉注射；(3)可以在生理条件以外的条件下进行筛选和应用；(4)可进行大量化学合成制备，批间差异小；(5)很容易进行结构改造、修饰、标记或固定化；(6)稳定性好，容易保存和运输；(7)分子量小，一般在4-50KD。基于这些优点，核酸适体作为一种新型识别分子已经被广泛应用于分析化学、生物传感器、疾病治疗和诊断等诸多领域。

目前所筛选得到的核酸适体都是识别某一单一靶标，难以实现对一类化合物或某一特定基团进行识别和用于对该类化合物的富集、分析检测。

发明内容

本发明的目的是提供一种识别含对硝基苯磺酰胺基的化合物的核酸适体及其应用。

本发明提供的核酸适体是序列表的序列1、序列3或序列5所示的单链DNA片段。

将序列表的序列1、序列3或序列5所示的单链DNA片段进行修饰或改造得到的核酸适体的衍生物也属于本发明的保护范围。

所述核酸适体衍生物可为如下任意一种：①将所述核酸适体删除部分或增加部分互补的核苷酸，得到与所述核酸适体具有相同功能的核酸适体的衍生物；②将所述核酸适体进行核苷酸取代或部分修饰，得到与所述核酸适体具有相同功能的核酸适体的衍生物；③将所述核酸适体的骨架改造为硫代磷酸脂骨架，得到与所述核酸适体具有相同功能的核酸适体的衍生物；④将所述核酸适体改为肽核酸，得到与所述核酸适体具有相同功能的核酸适体的衍生物；⑤将所述核酸适体的一端或中间接上信号分子(如荧光素FITC，FAM，罗丹明B，或放射性分子)、活性分子(如生物素、氨基、羧基、酶)或其它功能基团后，得到与所述核酸适体具有相同功能的核酸适体的衍生物。

本发明还保护核酸探针，为核酸探针甲、核酸探针乙或核酸探针丙；

所述核酸探针甲由DNA片段甲-1和DNA片段甲-2组成；所述DNA片段甲-1由序列表的序列1所示核苷酸组成且5’末端具有荧光报告基团(核酸适体元件)；所述DNA片段甲-2由9-11个与序列表的序列1反向互补的核苷酸组成且3’末端具有荧光淬灭基团(互补元件)；

所述核酸探针乙由DNA片段乙-1和DNA片段乙-2组成；所述DNA片段乙-1由序列表的序列3所示核苷酸组成且5’末端具有荧光报告基团(核酸适体元件)；所述DNA片段乙-2由9-11个与序列表的序列3反向互补的核苷酸组成且3’末端具有荧光淬灭基团(互补元件)；

所述核酸探针丙由DNA片段丙-1和DNA片段丙-2组成；所述DNA片段丙-1由序列表的序列5所示核苷酸组成且5’末端具有荧光报告基团(核酸适体元件)；所述DNA片段丙-2由9-11个与序列表的序列5反向互补的核苷酸组成且3’末端具有荧光淬灭基团(互补元件)。

所述DNA片段甲-1、DNA片段甲-2、DNA片段乙-1、DNA片段乙-2、DNA片段丙-1和DNA片段丙-2均为单链DNA。