[发明专利]猪鼻支原体巢式PCR检测方法有效
申请号: | 201210115339.7 | 申请日: | 2012-04-19 |
公开(公告)号: | CN102676658A | 公开(公告)日: | 2012-09-19 |
发明(设计)人: | 白方方;邵国青;武昱孜;刘茂军;冯志新;熊祺琰 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/35 |
代理公司: | 南京众联专利代理有限公司 32206 | 代理人: | 周新亚 |
地址: | 210014*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 支原体 pcr 检测 方法 | ||
1.一种猪鼻支原体的巢式PCR检测方法,其特征在于包括下列步骤:
1)提取猪鼻支原体样品的DNA,低温保存备用;
2)以一对特异性引物Mhr P01、Mhr P02对猪鼻支原体样品进行第一轮 PCR扩增;
其中:上游引物 Mhr P01的序列为:5’-GCATCTATATTTTCGCCAATAGC-3’;
下游引物 Mhr P02的序列为:5’-AGCTAGAGTTTCATCATTACC-3’;
所述第一轮 PCR扩增方法是:在PCR试剂管Ⅰ中的反应液总体积为20μl,包括:待测样品猪鼻支原体DNA模板提取液0.5~1.0μl, 10×PCR Buffer(Mg2+ Free) 1.0~2.5 μl, 25mM MgCl2 1.0~2.0μl,2.5mM dNTPs 1.0~3.0 μl,10pmol/μl上游引物Mhr P01 0.5~1.0μl,10pmol/μl下游引物Mhr P02 0.5~1.0μl, 5单位/μl TaqDNA聚合酶0.2~0.5μl,灭菌超纯水补至总体积20μl,3000~5000g离心2~5秒钟混匀,置于PCR仪内扩增反应;反应条件为:通过94~96℃ 解链2~5分钟,然后94~96℃变性40~60秒,50~56℃复性60秒,72℃延伸40~90秒,25~35个循环,最后72℃延伸6~10分钟,得猪鼻支原体第一轮PCR产物;
3)以另一对特异性引物Mhr P03、Mhr P04对猪鼻支原体第一轮PCR产物进行第二轮PCR扩增;
其中:上游引物 Mhr P03的序列为:5’-GTAGTCAAGCAAGAGGATGT-3’;
下游引物 Mhr P04的序列为:5’-GCTGGAGTTATTATACCAGGA-3’;
所述第二轮PCR扩增方法是:在PCR试剂管Ⅱ中加入猪鼻支原体第一轮PCR产物进行反应,其反应液总体积为20μl,包括:猪鼻支原体第一轮PCR产物0.5~.1.0μl, 10×PCR Buffer(Mg2+ Free) 1.0~2.5 μl, 25mM MgCl2 1.0~2.0μl,2.5mM dNTPs 1.0~3.0 μl,10pmol/μl上游引物Mhr P03 0.5~1.0μl,10pmol/μl下游引物Mhr P04 0.5~1.0μl, 5单位/μl TaqDNA聚合酶0.2~0.5μl,灭菌超纯水补至总体积20μl,3000~5000g离心2~5秒钟混匀,置于PCR仪内扩增反应;反应条件为:通过94~96℃解链2~5分钟,然后94~96℃变性40~60秒,46~50℃复性60秒,72℃延伸60~90秒,25~30个循环,最后72℃延伸6~10分钟,得猪鼻支原体第二轮PCR产物;
4)电泳检测
取猪鼻支原体第二轮PCR产物5~10μl,与2~6μl 0.25%(质量/体积)溴酚蓝上样缓冲液混合,在含0.8~2%(质量/体积)Goldview的0.7~1%(质量/体积)琼脂糖凝胶在电压80~100V下电泳20~30分钟,于凝胶成像系统中透射紫外灯下拍照检测,样品孔有一条346bp的核酸条带为有猪鼻支原体感染或污染的阳性样品,即可确定待测样品中含有病原菌猪鼻支原体,反之则没有。
2.如权利要求1所述的猪鼻支原体的巢式PCR检测方法,其特征在于所述dNTPs为dTTP与dATP、dCTP、dGTP四种浓度分别为2.5mM核苷酸的混合物。
3.如权利要求1或2所述检测猪鼻支原体巢式PCR方法,其特征在于所述第一轮PCR扩增的PCR反应管I中的反应液的最佳组分为:待测样品猪鼻支原体DNA模板提取液1.0μl,10×PCR Buffer(Mg2+ Free) 2.0 μl,25mM MgCl2 2.0μl,2.5mM dNTPs 2.0μl,10pmol/μl上游引物Mhr P01 0.5μl,10pmol/μl下游引物Mhr P02 0.5μl,5单位/μl TaqDNA聚合酶0.2μl,灭菌超纯水补至总体积20μl。
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