[发明专利]建鲤GAPDH基因含内含子的部分序列的克隆方法及其realtimePCR方法有效
申请号: | 201210120450.5 | 申请日: | 2012-04-23 |
公开(公告)号: | CN102643799A | 公开(公告)日: | 2012-08-22 |
发明(设计)人: | 唐永凯;李建林;俞菊华;李红霞;董在杰 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12N15/11 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 李纪昌 |
地址: | 214081 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 建鲤 gapdh 基因 内含 部分 序列 克隆 方法 及其 realtimepcr | ||
1.一种建鲤GAPDH基因含内含子的部分序列的克隆方法,按照以下步骤实现:建鲤血液基因组DNA提取,设计引物、PCR扩增,产物纯化,转入载体,蓝白斑筛选,质粒测序,其特征在于:所设计的引物序列为:
正向:CCGTTCATGCTATCACAGCTACACA
反向:GGAAGCAGGATCTTACCATGTGAC
用此方法克隆所得建鲤GAPDH基因含内含子的部分序列为如SEQ ID中No.1所述。
2.根据权利要求1所述克隆方法,其特征在于:所述PCR扩增的反应条件为:95℃ 3min;30循环94℃ 30s、57℃ 30s、72℃ 1min;72℃延长8min;4℃度保存。
3.一种real time PCR扩增权利要求1中所述建鲤GAPDH基因含内含子的部分序列的方法,按如下步骤实现:抽提总RNA,以Oigo dT Primer和Random 6 mers为引物进行RT反应,然后以此RT液为模板进行real time PCR,荧光染料为SYBR Green I,其特征在于:real time PCR中的建鲤引物为跨越内含子的定量引物,其序列为:
正向: AGCTCAATGGCAAGCTTACTGG
反向: GTGGATACCACCTGGTCCTCTG。
4.根据权利要求3中所述real time PCR扩增方法,其特征在于,所述real time PCR扩增的反应条件为:94℃ 3min,然后40个循环94℃ 5sec,62℃ 20sec,最后72℃ 3min,4℃保存。
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