[发明专利]结核分枝杆菌利福平耐药突变可视化检测探针及其应用有效
申请号: | 201210121847.6 | 申请日: | 2012-04-24 |
公开(公告)号: | CN102628085A | 公开(公告)日: | 2012-08-08 |
发明(设计)人: | 章晓联;周翔;邓明刚;冯烁;罗凤玲;孙小明 | 申请(专利权)人: | 武汉大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 武汉科皓知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 42222 | 代理人: | 薛玲 |
地址: | 430072 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 结核 分枝杆菌 利福平 耐药 突变 可视化 检测 探针 及其 应用 | ||
1.结核分枝杆菌利福平耐药突变可视化检测探针,其包括:
锚定探针,其3’端含有3段GGG序列参与G-四链体形成,或其3’端含有1段GGG序列参与G-四链体形成;
竞争探针,其互补区与野生型靶序列完全互补,所述野生型靶序列的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;
突变检测探针,其互补区与相应的突变型靶序列完全互补,其5‘端具有1段GGG序列参与G-四链体形成,或其5‘端具有3段GGG序列参与G-四链体形成;
绝缘探针,包括探针L和探针R,分别能结合在锚定探针靶向区域的下游和突变检测探针靶向区域的上游,和单链靶核酸形成稳定的双链;
所述锚定探针的互补区与靶序列上的与突变检测探针互补区段的下游互补,所述锚定探针与突变检测探针结合在相应的突变型靶序列上时,两者之间能够形成G-四链体。
2.根据权利要求1所述的可视化检测探针,其特征在于,所述锚定探针具有SEQ ID No.2所示的核苷酸序列,所述竞争探针具有SEQ ID No.3所示的核苷酸序列,所述突变检测探针为SEQ ID No.4~12所示核苷酸序列中的一个或多个,所述绝缘探针包括探针L和探针R,其核苷酸序列分别如SEQ ID No.13和14所示。
3.含有权利要求1或2所述可视化检测探针的试剂盒。
4.权利要求1或2所述可视化检测探针在结核分枝杆菌利福平耐药突变检测中的应用。
5.一种可视化检测结核分枝杆菌利福平耐药突变的方法,其包括如下步骤:
A、PCR扩增待测样品的靶核苷酸序列;
B、将上述A的探针与靶核苷酸互补配对,并加入Hemin,通过DNA过氧化物酶所催化的显色反应,来判断是否存在结核分枝杆菌利福平耐药突变。
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