[发明专利]一种miRNA检测探针和可视化检测miRNA的方法有效
申请号: | 201210133660.8 | 申请日: | 2012-05-03 |
公开(公告)号: | CN102618664A | 公开(公告)日: | 2012-08-01 |
发明(设计)人: | 周翔;王少儒;田沺;翁小成;肖珩 | 申请(专利权)人: | 武汉大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 武汉科皓知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 42222 | 代理人: | 汪俊锋 |
地址: | 430072 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 mirna 检测 探针 可视化 方法 | ||
技术领域
本发明属于分子生物学和核酸化学领域,涉及一种miRNA检测探针和可视化检测miRNA的方法。
背景技术
MicroRNAs(miRNAs)是真核细胞中发现的一类有调控功能的非编码RNA,通常大约有20~25个核苷酸。miRNAs是由较长的含有hairpin结构的前体经过Dicer酶的剪切加工形成的,随后与RNA诱导的沉默复合体(miRISCs)结合,并通过碱基互补配对识别相应的信使RNA(mRNA)。由于互补程度的不同,miRNA可以降解或阻遏靶mRNA阻遏靶mRNA的翻译。miRNA在动植物中有广泛表达,参与细胞增殖凋亡、发育、病毒防御、造血、器官形成、脂肪代谢等多种调节过程。miRNA具有保守性,特异性和时序性,只在特定的细胞和组织中表达,因此决定了细胞和组织功能的特异性。区别于寡核苷酸和RNA的降解片段,miRNA3’端为羟基,5’端有一个磷酸基。目前,miRNA的功能仅被部分阐明,近年来,有报道miRNA与细胞癌变具有密切关联。miRNA的功能类似于癌基因或抑癌基因,有些miRNA会协同行使癌基因的功能,使一些凋亡蛋白受到抑制而另外一些miRNA在正常组织中高表达,它们的缺失或低表达可以导致细胞的转化和一些癌基因的激活。因此,miRNA可以作为一个重要的肿瘤标识物,针对miRNA的检测对于早期诊断和愈后诊断有重要意义,同时也为其功能研究提供重要依据。
miRNA由于同源性高,长度较短,细胞或组织内含量低,针对它的高灵敏高选择性检测方法仍然有待进一步完善。目前的miRNA检测方法仍然以传统的Northern Blot为主,依赖于转印迹与杂交。这种方法主要的缺点在于工作流程长,操作复杂,费时,同时需要的样本量大,灵敏度有限,而且探针需要放射性或碱性磷酸酶等标记,这些都产生环境污染与资源浪费。近年发展了一些新的检测方法。芯片技术的发展为高通量检测及筛选带来重大突破,芯片的应用结合不同标记包括碱性磷酸酶,荧光标记,量子点纳米金等,提供了多种信号放大的途径,大大提高了检测的灵敏度。但是芯片及各种标记法均带来检测成本的提高。随后,分子信标的应用为miRNA的检测带来了新的途径,但是在检测miRNA的应用中由于miRNA长度的限制,使得分子信标环状区的长度局限于20-25个碱基左右,因而往往无法完全打开茎秆区而仅产生较低信号,同时分子信标荧光的产生只能是线性扩增,放大倍数不高。随后,RT-PCR的应用,滚环扩增,恒温指数扩增等均发展用来检测miRNA,这些方法各有优势,但是复杂的标记及探针设计,仪器的要求等仍然限制着它们的应用。
发明内容
本发明所要解决的技术问题在于提供一种miRNA检测探针和高灵敏低成本检测miRNA的方法。
本发明是基于G-四链体与血红素Hemin形成的复合物具有过氧化物酶活性,催化底物2,2′联氮双(3′-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸)二胺盐(ABTS)被过氧化氢氧化,产生绿色产物。
本发明的探针在靶标miRNA存在的条件下被双链特异性内切酶的酶切后释放出G-四链体形成序列,在钠钾离子及Hemin的共同作用下形成有过氧化物酶活性的复合物,对过氧化氢催化底物ABTS反应,产生绿色产物。此过程可肉眼观察,从而实现miRNA的可视化检测。工作原理如图1所示。
为实现上述目的,本发明所提供的检测探针如下:
一种miRNA检测探针,包括三个部分:靠近3′端为G-四链体形成序列,中间是待测靶标互补序列,5′端为干扰序列;
所述G-四链体形成序列含有4段GGG序列参与G-四链体形成;
所述待测靶标互补序列为loop环,与相应的靶miRNA完全互补;
所述干扰序列有5-10个与G-四链体形成序列互补的碱基。
所述G-四链体形成序列在非工作条件下,与干扰序列互补配对而不形成G4,整个探针为hairpin结构。仅当有待测靶标存在时,hairpin结构打开,在双链特异内切酶的作用下,G4序列被释放出来形成四链体结构,产生过氧化物酶活性。
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