[发明专利]THADA基因突变检测特异性引物和液相芯片无效

专利信息
申请号: 201210179335.5 申请日: 2012-05-31
公开(公告)号: CN103451271A 公开(公告)日: 2013-12-18
发明(设计)人: 许嘉森;吴诗扬 申请(专利权)人: 益善生物技术股份有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 代理人: 万志香
地址: 510663 广东省广州市广州科*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: thada 基因突变 检测 特异性 引物 芯片
【说明书】:

技术领域

发明属于分子生物学领域,涉及医学和生物技术,具体的是涉及一种THADA基因突变检测特异性引物和液相芯片。

背景技术

THADA基因为甲状腺腺瘤相关基因,英文名称为thyroid adenoma associated,编码甲状腺腺瘤相关的蛋白。THADA基因位于2号染色体短臂2p21,有38个外显子,长度约365kb,在全身各种组织中广泛表达,尤其是肝脏。其全基因组关联研究的Meta分析发现THADA基因在欧洲人群中与2型糖尿病相关。THADA基因是在甲状腺良性肿瘤中被发现的特定染色体重组的目标基因,因此它也是在良性上皮肿瘤染色体重组中最常用的目标基因。另外,THADA基因可能与多囊卵巢综合征,前列腺癌,乳腺癌相关。

目前,THADA基因突变检测方法主要有:基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术,荧光定量PCR技术,Illumina光纤微珠芯片技术,基质辅助激光解析电离时间飞行质谱技术是一种软电离技术,在蛋白质等生物大分子的检测中有着强大而成熟的功能,但是在核酸检测领域,由于核酸分子本身的特殊性,检测受到一定的限制。而其它以PCR为基础的检测技术,如荧光定量PCR技术,则存在灵敏度低,样品易污染、假阳性率高的缺点。Illumina光纤微珠芯片技术虽然是高灵敏度和精确性的高通量检测系统,但是自动化程度低,手工操作比较多,也不能满足实际应用的需要。

本发明目标检测的THADA基因突变位点,如表所示:

  序号  TERT基因位点突变的内容  简写  1  SEQ ID NO.57的第109位核苷酸,发生A→G突变  A109G  2  SEQ ID NO.58的第156位核苷酸,发生T→C突变  T156C  3  SEQ ID NO.59的第89位核苷酸,发生A→C突变  A89C  4  SEQ ID NO.60的第153位核苷酸,发生G→A突变  G153A  5  SEQ ID NO.61的第162位核苷酸,发生G→T突变  G162T  6  SEQ ID NO.62的第80位核苷酸,发生C→T突变  C80T

SEQ ID NO.57突变位点:A109G

AGACAGTAGCAACCTAAAGCCAAAACAGCAGTTTCCAGCCCTCTGAAGATGGCAGTG

AATTCTGGTAGAGCTTGGTAAGTCCAAAGTGAATTCCCTCTCTCTTCCAGGAGCCCAC

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