[发明专利]一种人心肌肌钙蛋白I适配子及筛选方法和应用无效
申请号: | 201210227783.8 | 申请日: | 2012-07-03 |
公开(公告)号: | CN102703455A | 公开(公告)日: | 2012-10-03 |
发明(设计)人: | 张娟琨;刘珺;蒋树海;徐锦锋 | 申请(专利权)人: | 天津科技大学 |
主分类号: | C12N15/115 | 分类号: | C12N15/115;C12N15/10;C12Q1/68;C07K14/47 |
代理公司: | 天津盛理知识产权代理有限公司 12209 | 代理人: | 王来佳 |
地址: | 300457 天津市滨海新*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 人心 肌钙蛋白 配子 筛选 方法 应用 | ||
1.一种人心肌肌钙蛋白I适配子,其特征在于:具有序列表中SEQ ID No.1所述的核苷酸序列或具有序列表中SEQ ID No.2所述的核苷酸序列或具有序列表中SEQ ID No.3所述的核苷酸序列或具有序列表中SEQ ID No.4所述的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的人心肌肌钙蛋白I适配子,其特征在于:所述SEQ ID No.1所述的核苷酸序列具有下述结构:
所述SEQ ID No.2所述的核苷酸序列具有下述结构:
所述SEQ ID No.3所述的核苷酸序列具有下述结构:
所述SEQ ID No.4所述的核苷酸序列具有下述结构:
3.一种如权利要求1所述的人心肌肌钙蛋白I适配子的筛选方法,其特征在于:步骤如下:
⑴合成随机ssDNA文库
合成长度为81bp的随机ssDNA文库,两端为固定序列,中间19个碱基为随机序列;
P81库:5'-CGG GAA TTCTAT GGC GGA TGG GAG CGAN19GCC GCA AGA AAAAGT TTG AGA GCAAGC TTC CG-3′。
其中:上游引物为:序列5;下游引物为:序列6;
⑵人心肌肌钙蛋白I适配子的筛选
将人心肌肌钙蛋白I按照表1中的量包被,包被液为pH9.6,0.05mol/LNaHCO3,于4℃过夜,同时设空白对照孔,其样品孔和空白对照孔均加入50μL3%BSA封闭2h,4℃过夜;
将合成的随机ssDNA文库配制成浓度为100μmol/L的溶液;将200μL结合缓冲液与随机ssDNA文库按照表1中的文库量进行混合,在90℃下加热变性5min后,迅速置于冰上10min,然后室温变性15min;
再将已变性的ssDNA先与由3%BSA封闭的空白对照孔结合,37℃孵育,然后转移到人心肌肌钙蛋白I包被孔与人心肌肌钙蛋白I结合,37℃孵育40min,反筛除去与BSA结合ssDNA;
用洗涤缓冲液洗涤,洗去未结合心肌肌钙蛋白I的ssDNA;
在人心肌肌钙蛋白I与ssDNA结合的孔中加入洗脱缓冲液,80℃下培养10min,洗脱下与人心肌肌钙蛋白I结合的ssDNA;
向洗脱液中加入等体积的酚:氯仿抽提,震荡混匀后4℃、10000rpm离心5min,吸上清,向上清中加入2倍上清液体积的无水乙醇沉淀ssDNA,4℃、10000rpm离心5min,弃去上清,用1mL70%乙醇洗涤沉淀,37℃倒置烘干;
将沉淀溶解于20μL TE缓冲液中,贮存于-20℃,作为PCR反应的模板;
⑶PCR扩增单链DNA过程
PCR扩增引物:上游引物:序列5;下游引物:序列6;
扩增模板为步骤⑵中洗脱纯化的ssDNA,其扩增的反应条件为:94℃预变性3min;然后,94℃变性45s,60℃退火30s,72℃延伸40s,12个循环;最后,72℃延伸7min;
反应体系25μL:ssDNA模板1μL,10×PCR Buffer2.5μL,MgCl21.5μL,10mM的dNTPs2.5μL,10pmo l的上、下游引物各2μL,,Taq酶0.2μL,灭菌双蒸水13.3μL;
⑷不对称PCR制备ssDNA次级文库
上游引物:序列7;下游引物:序列8;上游引物:下游引物的比例为80:1;
扩增模板为步骤⑶中的PCR扩增产物,其扩增的反应条件为:94℃预变性3min;然后,94℃变性45s,60℃退火30s,72℃延伸40s,40个循环;最后,72℃延伸7min;
反应体系25μL:ssDNA模板1μL,10×PCR Buffer2.5μL,MgCl21.5μL,10mM的dNTPs2.5μL,10pmol的上游引物和下游引物的量共为4μL,Taq酶0.2μL,灭菌双蒸水13.3μL;
表1心肌肌钙蛋白I蛋白适配子的12轮筛选的参数
4.权利要求1或2所述的人心肌肌钙蛋白I适配子在心肌肌钙蛋白I早期检测和临床心肌损伤的诊断上的应用或应用于心肌肌钙蛋白I的分离纯化。
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