[发明专利]一种用于核酸实时检测的探针及其应用有效
申请号: | 201210245826.5 | 申请日: | 2012-07-17 |
公开(公告)号: | CN103540652A | 公开(公告)日: | 2014-01-29 |
发明(设计)人: | 刘晓光 | 申请(专利权)人: | 刘晓光 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 宁波诚源专利事务所有限公司 33102 | 代理人: | 袁忠卫 |
地址: | 316000 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 核酸 实时 检测 探针 及其 应用 | ||
1.一种用于核酸实时检测的探针,其特征在于:探针是一条寡核苷酸,包括十个部分区域,3`端的第一区域(1)与5`端的第八区域(8)形成第一段双链,使得5`端连接的荧光基团或荧光供体(10)与3`端连接的淬灭基团或荧光受体(9)靠近,从而无荧光发出;第二区域(2)和第四区域(4)配对、第五区域(5)和第七区域(7)配对,构成另外2段双链;而第三区域(3)和第六区域(6)分别形成两个环形结构;并使探针的第三区(3)、第四区(4)、第五区(5)、第六区(6)的碱基与靶序列互补,形成靶序列结合区。
2.根据权利要求1所述的用于核酸实时检测的探针,其特征在于所述的位于3`端和5`端第一段双链结合区的长度为5-20bp。
3.根据权利要求1所述的用于核酸实时检测的探针,其特征在于所述的位于3`端与所述的靶序列结合区中一段序列互补双链结合区的长度为3-10bp。
4.根据权利要求1所述的用于核酸实时检测的探针,其特征在于所述的位于5`端与所述的靶序列结合区中一段序列互补双链结合区的长度为3-10bp。
5.根据权利要求1所述的用于核酸实时检测的探针,其特征在于靠近所述的靶序列结合区3`端的3`端环形结构的长度为3-15bp。
6.根据权利要求1所述的用于核酸实时检测的探针,其特征在于靠近所述的靶序列结合区5`端的5`端环形结构的长度为3-15bp。
7.根据权利要求1所述的用于核酸实时检测的探针,其特征在于所述的探针总长度为20-100bp,其中靶序列结合区10-50bp。
8.根据权利要求1所述的用于核酸实时检测的探针,其特征在于所述的探针为DNA或RNA。
9.根据权利要求1所述的用于核酸实时检测的探针,其特征在于所述的靶序列结合区中,可以引入至少一个或不引入非自然的核苷。
10.根据权利要求1~9任意一项权利要求所述的用于核酸实时检测的探针,其特征在于所述的第一段双链在中心线位置,而第二区域(2)和第四区域(4)配对双链和第五区域(5)和第七区域(7)配对双链接着分布在第一段双链的两侧,第三区域(3)的环形结构在第二区域(2)和第四区域(4)配对双链之间,第六区域(6)的环形结构在第五区域(5)和第七区域(7)配对双链之间。
11.根据权利要求1~9任意一项权利要求所述的用于核酸实时检测的探针,其特征在于所述的探针内部双链结合区域Tm值与扩增引物Tm值相当或高于退火温度2-12℃。
12.一种权利要求1~11任意一项权利要求所述的用于核酸实时检测的探针,其特征在于在靶序列实时PCR检测方法上应用。
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