[发明专利]HOXA1基因及其表达产物的应用

说明书

技术领域

本发明涉及一种基因的应用，特别是涉及一种HOXA1基因及其表达产物的应用。

背景技术

肝癌严重威胁着我国人民的生命健康。肝癌的诊断，尤其早期诊断是临床诊疗和预后的关键。肝癌的治疗在过去20年来已取得很大的进展，外科手术切除及肝脏移植属于“根治性”治疗，仍是肝癌治疗的首要选择。随着肝癌早期诊断水平的提高及肿瘤治疗生物学概念的改变，肿瘤局部非手术治疗在肝癌治疗中的地位日益提高。经导管动脉内化疗栓塞（TACE）已成为不能切除肝癌治疗的首选方法，是中晚期肝癌治疗的重要手段。该方法可使90%以上的肝癌患者受益，但总体疗效有待提高。此外，经皮肝穿刺瘤内无水乙醇治疗（PEI）也是较常用的局部化疗方法，对癌直径<3cm的肝癌及门静脉癌栓的治疗有一定价值。但目前肝癌的化疗药物基本沿用其他肿瘤的治疗药物，针对性差，疗效不佳，因此，迫切需要寻找新的作用靶点，研究和开发肝癌特异的新药物，提高化疗的特异性和有效性。近几年来随着对肝癌基础研究的深入，生物治疗在肝癌的综合治疗中取得了较大进展，成了继手术、放疗、化疗后肿瘤治疗的第四大疗法，如免疫治疗、基因治疗，包括抗血管生成、自杀基因治疗、肿瘤疫苗治疗、siRNA技术等。但许多生物治疗的临床疗效仍不十分满意，且绝大多数还处在实验研究阶段，相关的关键理论和实验技术仍需进一步研究和发展。

HOXA1基因在脊椎动物中，有一类同源基因编码一组转录因子，则一类转录因子分为A，B，C，D家族，这类基因分布于四个不同的染色体上。这些蛋白的表达时间和空间随着胚胎发育而改变。HOXA1基因位于7号染色体上的A家族的一员，编码了一个与DNA结合的转录因子，从而调控基因表达，形态形成还有分化。有关HOXA1基因的研究文献报道较少,特别是HOXA1基因与肝癌的关系研究还未见文献报道。

发明内容

本发明要解决的技术问题之一是提供一种HOXA1基因及其表达产物在制备诊断肝癌的产品中的应用。

本发明要解决的技术问题之二是提供一种HOXA1基因及其表达产物在制备治疗肝癌的药物中的应用。

本发明要解决的技术问题之三是提供一对特异扩增HOXA1基因的引物，该引物可用于制备用实时定量PCR诊断肝癌的产品。

本发明要解决的技术问题之四是提供HOXA1基因特定编码DNA片段的测序引物，该测序引物可用于制备用DNA测序诊断肝癌的产品。

本发明要解决的技术问题之五是提供HOXA1基因的siRNAs，该siRNAs可用于制备治疗肝癌的药物。

外显子组测序是针对基因组中的蛋白质编码区，靶向富集外显子区域测序，以发现疾病相关遗传变异的技术。该技术近年越来越多地应用于发现人类基因组低频变异、鉴定单基因遗传病致病基因和肿瘤等复杂疾病易感基因研究，成为人类疾病相关变异研究的重要工具。为了鉴定肝癌发病过程中所发生体细胞突变的基因，本发明采用了外显子组测序技术分析了10例伴有肝内门静脉癌栓的肝癌病人原位癌组织、门静脉癌栓组织及对应的癌旁组织。通过对高通量数据进行严谨的分析，过滤筛选出475个可靠的点突变。为了鉴定重要的肝癌相关基因，通过针对91个被Sanger测序方法验证具有突变的基因设计特异性siRNAs，在8株肝癌细胞株中筛选显著影响细胞生存的候选基因。定量PCR检测HOXA1基因在部分肝癌病人癌组织中表达上调。在脊椎动物中，有一类称之为“homebox”基因，它们编码转录因子，成簇分布于四条不同的染色体上。胚胎发育时这些蛋白的表达根据时间及空间变化而被调控。HOXA1基因编码DNA结合转录因子，调节基因表达、形态发生及分化。

为了解决上述技术问题，本发明通过如下技术方案实现：

在本发明的一方面，提供了一种HOXA1基因及其表达产物在制备诊断肝癌的产品中的应用。

所述诊断肝癌的产品包括：用实时定量PCR诊断肝癌的产品、用DNA测序诊断肝癌的产品。

所述用实时定量PCR诊断肝癌的产品至少包括一对特异扩增HOXA1基因的引物。

所述用DNA测序诊断肝癌的产品包括：用于HOXA1基因特定编码序列的测序引物。

在本发明的另一方面，提供了一种用于制备用实时定量PCR诊断肝癌的产品中的一对特异扩增HOXA1基因的引物，所述引物的上游引物序列具有如SEQ ID NO:9所示的序列或其互补序列，所述引物对的下游引物序列具有如SEQ ID NO:10所示的序列或其互补序列。