[发明专利]SUCLA2基因突变体及其应用有效
申请号: | 201210249131.4 | 申请日: | 2012-07-18 |
公开(公告)号: | CN103571854A | 公开(公告)日: | 2014-02-12 |
发明(设计)人: | 方明艳;刘轩竹;王海荣;王俊;汪建;杨焕明 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/52 | 分类号: | C12N15/52;C12N9/00;C12Q1/68;C12M1/34 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 李志东 |
地址: | 518083 广东省深圳市盐田*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | sucla2 基因 突变体 及其 应用 | ||
技术领域
本发明涉及SUCLA2基因突变体及其应用。具体地,本发明涉及分离的编码琥珀酸辅酶A连接酶β亚基突变体的核酸、分离的多肽、筛选易感线粒体DNA耗竭综合征的生物样品的方法、筛选易感线粒体DNA耗竭综合征的生物样品的系统以及用于筛选易感线粒体DNA耗竭综合征的生物样品的试剂盒。
背景技术
线粒体呼吸链复合酶(Multiple mitochondrial respiratory chain,MRC)缺陷是导致线粒体疾病的重要原因,受多种分子遗传机制影响,如线粒体DNA(mtDNA)缺失,线粒体tRNA点突变,线粒体RNA翻译缺陷,线粒体DNA(mtDNA)耗竭,呼吸链亚基组装或调节功能缺陷,线粒体蛋白质输入受损。儿童期发病的线粒体疾病主要由mtDNA耗竭导致(mitochondrial DNA depletion syndromes,MDS,MIM 251880,线粒体DNA耗竭综合征),MDS不同于其他线粒体疾病,它是一数量上出现缺陷的疾病而非质量上的问题,表现为mtDNA拷贝数减少,而线粒体本身数目可能正常,缺失或是增多,导致细胞中呼吸链复合体的合成与ATP合成下降,降低了线粒体的能量代谢功能,为常染色体隐性遗传,具有遗传和临床上的异质性。临床上可分为肝脑病变型、肌肉病变型、其他型如Alpers综合征等三种类型。研究表明,许多核基因编码的基因突变与上述疾病相关。
然而,现阶段对线粒体DNA耗竭综合征的研究仍有待深入。
发明内容
本发明旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此,本发明的一个目的在于提出线粒体DNA耗竭综合征(有时也称为“MDS”)的致病基因上的新突变。
本发明是基于发明人的下列工作而完成的:发明人通过高通量外显子组测序联合候选基因突变验证的方法确定了线粒体DNA耗竭综合征的致病基因上的新突变(SUCLA2,c.C308A)。
根据本发明的第一方面,本发明提出了一种分离的编码琥珀酸辅酶A连接酶β亚基突变体的核酸(即SUCLA2基因突变体)。根据本发明的实施例,该核酸与SEQ ID NO:1相比,具有c.C308A突变。根据本发明的实施例,发明人确定了SUCLA2基因突变体,该突变体与MDS的发病密切相关,从而通过检测该突变体在生物样品中是否存在,可以有效地检测生物样品是否易感线粒体DNA耗竭综合征。
根据本发明的第二方面,本发明提出了一种分离的多肽。根据本发明的实施例,该多肽与SEQ ID NO:2相比,具有p.Ala103Asp突变。通过检测生物样品中是否表达该多肽,可以有效地检测生物样品是否易感线粒体DNA耗竭综合征。
根据本发明的第三方面,本发明提出了一种筛选易感线粒体DNA耗竭综合征的生物样品的方法。根据本发明的实施例,该方法包括以下步骤:从生物样品提取核酸样本;确定所述核酸样本的核酸序列;所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO:1相比,具有c.C308A突变是所述生物样品易感线粒体DNA耗竭综合征的指示。通过根据本发明实施例的筛选易感线粒体DNA耗竭综合征(即MDS)的生物样品的方法,可以有效地筛选易感MDS的生物样品。
根据本发明的第四方面,本发明提出了一种筛选易感线粒体DNA耗竭综合征的生物样品的系统。根据本发明的实施例,该系统包括:核酸提取装置,所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本;核酸序列确定装置,所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连,用于对所述核酸样本进行分析,以便确定所述核酸样本的核酸序列;判断装置,所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连,以便基于所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO:1相比,是否具有c.C308A突变,判断所述生物样品是否易感线粒体DNA耗竭综合征。利用该系统,能够有效地实施前述筛选易感线粒体DNA耗竭综合征的生物样品的方法,从而可以有效地筛选易感线粒体DNA耗竭综合征的生物样品。
根据本发明的第五方面,本发明提出了一种用于筛选易感线粒体DNA耗竭综合征的生物样品的试剂盒。根据本发明的实施例,该试剂盒含有:适于检测SUCLA2基因突变体的试剂,其中与SEQ ID NO:1相比,所述SUCLA2基因突变体具有c.C308A突变。利用根据本发明的实施例的试剂盒,能够有效地筛选易感线粒体DNA耗竭综合征的生物样品。
本发明的附加方面和优点将在下面的描述中部分给出,部分将从下面的描述中变得明显,或通过本发明的实践了解到。
附图说明
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